Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y496

KIF3A, Kinesin-like protein KIF3A, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF3AQ9Y496 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KIF3AQ9Y496 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KIF3AQ9Y496 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KIF3AQ9Y496 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KIF3AQ9Y496 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KIF3AQ9Y496 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KIF3AQ9Y496 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KIF3AQ9Y496 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KIF3AQ9Y496 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KIF3AQ9Y496 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KIF3AQ9Y496 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KIF3AQ9Y496 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KIF3AQ9Y496 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
KIF3AQ9Y496 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KIF3AQ9Y496 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KIF3AQ9Y496 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KIF3AQ9Y496 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KIF3AQ9Y496 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KIF3AQ9Y496 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KIF3AQ9Y496 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KIF3AQ9Y496 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KIF3AQ9Y496 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KIF3AQ9Y496 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KIF3AQ9Y496 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KIF3AQ9Y496 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KIF3AQ9Y496 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KIF3AQ9Y496 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KIF3AQ9Y496 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KIF3AQ9Y496 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KIF3AQ9Y496 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KIF3AQ9Y496 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KIF3AQ9Y496 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KIF3AQ9Y496 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
KIF3AQ9Y496 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KIF3AQ9Y496 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KIF3AQ9Y496 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KIF3AQ9Y496 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
KIF3AQ9Y496 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
KIF3AQ9Y496 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
KIF3AQ9Y496 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KIF3AQ9Y496 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KIF3AQ9Y496 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KIF3AQ9Y496 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KIF3AQ9Y496 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KIF3AQ9Y496 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KIF3AQ9Y496 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KIF3AQ9Y496 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KIF3AQ9Y496 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KIF3AQ9Y496 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KIF3AQ9Y496 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KIF3AQ9Y496 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KIF3AQ9Y496 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KIF3AQ9Y496 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KIF3AQ9Y496 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
KIF3AQ9Y496 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
KIF3AQ9Y496 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KIF3AQ9Y496 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KIF3AQ9Y496 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KIF3AQ9Y496 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
KIF3AQ9Y496 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KIF3AQ9Y496 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KIF3AQ9Y496 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KIF3AQ9Y496 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KIF3AQ9Y496 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KIF3AQ9Y496 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KIF3AQ9Y496 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KIF3AQ9Y496 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KIF3AQ9Y496 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KIF3AQ9Y496 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KIF3AQ9Y496 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KIF3AQ9Y496 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KIF3AQ9Y496 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KIF3AQ9Y496 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KIF3AQ9Y496 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
KIF3AQ9Y496 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
KIF3AQ9Y496 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KIF3AQ9Y496 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KIF3AQ9Y496 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KIF3AQ9Y496 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KIF3AQ9Y496 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC22■■□□□ 1.11
KIF3AQ9Y496 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KIF3AQ9Y496 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KIF3AQ9Y496 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KIF3AQ9Y496 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KIF3AQ9Y496 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KIF3AQ9Y496 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC22■■□□□ 1.11
KIF3AQ9Y496 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
KIF3AQ9Y496 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC22■■□□□ 1.11
KIF3AQ9Y496 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
KIF3AQ9Y496 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KIF3AQ9Y496 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
KIF3AQ9Y496 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
KIF3AQ9Y496 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC22■■□□□ 1.11
KIF3AQ9Y496 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
KIF3AQ9Y496 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KIF3AQ9Y496 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KIF3AQ9Y496 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
KIF3AQ9Y496 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KIF3AQ9Y496 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KIF3AQ9Y496 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms