Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K7

KDM2A, Lysine-specific demethylase 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM2AQ9Y2K7 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
KDM2AQ9Y2K7 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
KDM2AQ9Y2K7 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
KDM2AQ9Y2K7 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
KDM2AQ9Y2K7 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
KDM2AQ9Y2K7 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
KDM2AQ9Y2K7 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
KDM2AQ9Y2K7 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
KDM2AQ9Y2K7 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
KDM2AQ9Y2K7 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
KDM2AQ9Y2K7 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
KDM2AQ9Y2K7 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
KDM2AQ9Y2K7 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
KDM2AQ9Y2K7 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
KDM2AQ9Y2K7 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
KDM2AQ9Y2K7 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
KDM2AQ9Y2K7 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
KDM2AQ9Y2K7 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
KDM2AQ9Y2K7 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
KDM2AQ9Y2K7 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
KDM2AQ9Y2K7 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
KDM2AQ9Y2K7 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
KDM2AQ9Y2K7 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
KDM2AQ9Y2K7 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
KDM2AQ9Y2K7 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
KDM2AQ9Y2K7 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
KDM2AQ9Y2K7 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
KDM2AQ9Y2K7 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
KDM2AQ9Y2K7 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
KDM2AQ9Y2K7 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
KDM2AQ9Y2K7 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
KDM2AQ9Y2K7 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
KDM2AQ9Y2K7 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
KDM2AQ9Y2K7 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
KDM2AQ9Y2K7 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
KDM2AQ9Y2K7 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
KDM2AQ9Y2K7 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
KDM2AQ9Y2K7 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.88
KDM2AQ9Y2K7 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.88
KDM2AQ9Y2K7 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
KDM2AQ9Y2K7 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
KDM2AQ9Y2K7 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
KDM2AQ9Y2K7 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
KDM2AQ9Y2K7 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
KDM2AQ9Y2K7 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
KDM2AQ9Y2K7 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
KDM2AQ9Y2K7 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
KDM2AQ9Y2K7 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
KDM2AQ9Y2K7 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
KDM2AQ9Y2K7 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
KDM2AQ9Y2K7 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
KDM2AQ9Y2K7 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
KDM2AQ9Y2K7 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
KDM2AQ9Y2K7 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
KDM2AQ9Y2K7 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
KDM2AQ9Y2K7 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
KDM2AQ9Y2K7 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
KDM2AQ9Y2K7 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
KDM2AQ9Y2K7 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
KDM2AQ9Y2K7 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
KDM2AQ9Y2K7 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
KDM2AQ9Y2K7 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
KDM2AQ9Y2K7 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
KDM2AQ9Y2K7 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
KDM2AQ9Y2K7 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
KDM2AQ9Y2K7 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
KDM2AQ9Y2K7 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
KDM2AQ9Y2K7 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
KDM2AQ9Y2K7 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
KDM2AQ9Y2K7 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
KDM2AQ9Y2K7 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
KDM2AQ9Y2K7 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
KDM2AQ9Y2K7 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
KDM2AQ9Y2K7 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
KDM2AQ9Y2K7 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
KDM2AQ9Y2K7 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
KDM2AQ9Y2K7 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
KDM2AQ9Y2K7 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
KDM2AQ9Y2K7 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
KDM2AQ9Y2K7 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
KDM2AQ9Y2K7 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
KDM2AQ9Y2K7 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
KDM2AQ9Y2K7 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
KDM2AQ9Y2K7 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
KDM2AQ9Y2K7 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
KDM2AQ9Y2K7 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
KDM2AQ9Y2K7 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
KDM2AQ9Y2K7 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
KDM2AQ9Y2K7 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
KDM2AQ9Y2K7 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
KDM2AQ9Y2K7 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
KDM2AQ9Y2K7 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
KDM2AQ9Y2K7 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
KDM2AQ9Y2K7 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
KDM2AQ9Y2K7 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
KDM2AQ9Y2K7 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
KDM2AQ9Y2K7 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
KDM2AQ9Y2K7 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
KDM2AQ9Y2K7 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
KDM2AQ9Y2K7 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms