Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2G9

SBNO2, Protein strawberry notch homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBNO2Q9Y2G9 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SBNO2Q9Y2G9 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SBNO2Q9Y2G9 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SBNO2Q9Y2G9 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SBNO2Q9Y2G9 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SBNO2Q9Y2G9 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
SBNO2Q9Y2G9 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SBNO2Q9Y2G9 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SBNO2Q9Y2G9 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SBNO2Q9Y2G9 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SBNO2Q9Y2G9 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SBNO2Q9Y2G9 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SBNO2Q9Y2G9 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SBNO2Q9Y2G9 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
SBNO2Q9Y2G9 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SBNO2Q9Y2G9 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SBNO2Q9Y2G9 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SBNO2Q9Y2G9 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SBNO2Q9Y2G9 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SBNO2Q9Y2G9 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SBNO2Q9Y2G9 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SBNO2Q9Y2G9 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SBNO2Q9Y2G9 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SBNO2Q9Y2G9 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SBNO2Q9Y2G9 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SBNO2Q9Y2G9 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SBNO2Q9Y2G9 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SBNO2Q9Y2G9 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SBNO2Q9Y2G9 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SBNO2Q9Y2G9 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SBNO2Q9Y2G9 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SBNO2Q9Y2G9 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SBNO2Q9Y2G9 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SBNO2Q9Y2G9 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SBNO2Q9Y2G9 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SBNO2Q9Y2G9 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SBNO2Q9Y2G9 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SBNO2Q9Y2G9 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SBNO2Q9Y2G9 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SBNO2Q9Y2G9 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SBNO2Q9Y2G9 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
SBNO2Q9Y2G9 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SBNO2Q9Y2G9 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SBNO2Q9Y2G9 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SBNO2Q9Y2G9 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SBNO2Q9Y2G9 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SBNO2Q9Y2G9 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SBNO2Q9Y2G9 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SBNO2Q9Y2G9 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SBNO2Q9Y2G9 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
SBNO2Q9Y2G9 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SBNO2Q9Y2G9 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
SBNO2Q9Y2G9 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SBNO2Q9Y2G9 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SBNO2Q9Y2G9 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SBNO2Q9Y2G9 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SBNO2Q9Y2G9 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SBNO2Q9Y2G9 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SBNO2Q9Y2G9 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SBNO2Q9Y2G9 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SBNO2Q9Y2G9 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SBNO2Q9Y2G9 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SBNO2Q9Y2G9 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SBNO2Q9Y2G9 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
SBNO2Q9Y2G9 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
SBNO2Q9Y2G9 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SBNO2Q9Y2G9 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SBNO2Q9Y2G9 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SBNO2Q9Y2G9 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SBNO2Q9Y2G9 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SBNO2Q9Y2G9 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SBNO2Q9Y2G9 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SBNO2Q9Y2G9 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SBNO2Q9Y2G9 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SBNO2Q9Y2G9 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SBNO2Q9Y2G9 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SBNO2Q9Y2G9 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
SBNO2Q9Y2G9 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
SBNO2Q9Y2G9 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SBNO2Q9Y2G9 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SBNO2Q9Y2G9 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SBNO2Q9Y2G9 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SBNO2Q9Y2G9 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SBNO2Q9Y2G9 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SBNO2Q9Y2G9 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SBNO2Q9Y2G9 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SBNO2Q9Y2G9 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SBNO2Q9Y2G9 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SBNO2Q9Y2G9 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SBNO2Q9Y2G9 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SBNO2Q9Y2G9 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SBNO2Q9Y2G9 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SBNO2Q9Y2G9 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SBNO2Q9Y2G9 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
SBNO2Q9Y2G9 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SBNO2Q9Y2G9 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SBNO2Q9Y2G9 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SBNO2Q9Y2G9 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SBNO2Q9Y2G9 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SBNO2Q9Y2G9 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms