Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y285

FARSA, Phenylalanine--tRNA ligase alpha subunit, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FARSAQ9Y285 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FARSAQ9Y285 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FARSAQ9Y285 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FARSAQ9Y285 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FARSAQ9Y285 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FARSAQ9Y285 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FARSAQ9Y285 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FARSAQ9Y285 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FARSAQ9Y285 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FARSAQ9Y285 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FARSAQ9Y285 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FARSAQ9Y285 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FARSAQ9Y285 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FARSAQ9Y285 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FARSAQ9Y285 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FARSAQ9Y285 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FARSAQ9Y285 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FARSAQ9Y285 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FARSAQ9Y285 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FARSAQ9Y285 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FARSAQ9Y285 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FARSAQ9Y285 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FARSAQ9Y285 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FARSAQ9Y285 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FARSAQ9Y285 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FARSAQ9Y285 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FARSAQ9Y285 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FARSAQ9Y285 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FARSAQ9Y285 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FARSAQ9Y285 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FARSAQ9Y285 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FARSAQ9Y285 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
FARSAQ9Y285 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
FARSAQ9Y285 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FARSAQ9Y285 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FARSAQ9Y285 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FARSAQ9Y285 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FARSAQ9Y285 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FARSAQ9Y285 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
FARSAQ9Y285 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
FARSAQ9Y285 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.42
FARSAQ9Y285 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
FARSAQ9Y285 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
FARSAQ9Y285 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
FARSAQ9Y285 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FARSAQ9Y285 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FARSAQ9Y285 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FARSAQ9Y285 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FARSAQ9Y285 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FARSAQ9Y285 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FARSAQ9Y285 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FARSAQ9Y285 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FARSAQ9Y285 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
FARSAQ9Y285 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
FARSAQ9Y285 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FARSAQ9Y285 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FARSAQ9Y285 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
FARSAQ9Y285 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FARSAQ9Y285 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FARSAQ9Y285 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FARSAQ9Y285 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FARSAQ9Y285 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FARSAQ9Y285 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FARSAQ9Y285 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FARSAQ9Y285 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FARSAQ9Y285 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FARSAQ9Y285 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
FARSAQ9Y285 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FARSAQ9Y285 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FARSAQ9Y285 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FARSAQ9Y285 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FARSAQ9Y285 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
FARSAQ9Y285 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FARSAQ9Y285 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FARSAQ9Y285 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FARSAQ9Y285 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FARSAQ9Y285 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FARSAQ9Y285 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FARSAQ9Y285 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
FARSAQ9Y285 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FARSAQ9Y285 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
FARSAQ9Y285 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FARSAQ9Y285 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
FARSAQ9Y285 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FARSAQ9Y285 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FARSAQ9Y285 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FARSAQ9Y285 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FARSAQ9Y285 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FARSAQ9Y285 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FARSAQ9Y285 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FARSAQ9Y285 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FARSAQ9Y285 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FARSAQ9Y285 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FARSAQ9Y285 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FARSAQ9Y285 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FARSAQ9Y285 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FARSAQ9Y285 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FARSAQ9Y285 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FARSAQ9Y285 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FARSAQ9Y285 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms