Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPU9

SAMD4A, Protein Smaug homolog 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD4AQ9UPU9 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SAMD4AQ9UPU9 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SAMD4AQ9UPU9 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SAMD4AQ9UPU9 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SAMD4AQ9UPU9 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SAMD4AQ9UPU9 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SAMD4AQ9UPU9 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SAMD4AQ9UPU9 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SAMD4AQ9UPU9 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SAMD4AQ9UPU9 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SAMD4AQ9UPU9 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SAMD4AQ9UPU9 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SAMD4AQ9UPU9 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SAMD4AQ9UPU9 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SAMD4AQ9UPU9 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SAMD4AQ9UPU9 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SAMD4AQ9UPU9 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SAMD4AQ9UPU9 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SAMD4AQ9UPU9 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SAMD4AQ9UPU9 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SAMD4AQ9UPU9 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SAMD4AQ9UPU9 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SAMD4AQ9UPU9 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SAMD4AQ9UPU9 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SAMD4AQ9UPU9 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SAMD4AQ9UPU9 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SAMD4AQ9UPU9 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SAMD4AQ9UPU9 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SAMD4AQ9UPU9 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SAMD4AQ9UPU9 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SAMD4AQ9UPU9 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SAMD4AQ9UPU9 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SAMD4AQ9UPU9 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SAMD4AQ9UPU9 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SAMD4AQ9UPU9 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SAMD4AQ9UPU9 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SAMD4AQ9UPU9 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SAMD4AQ9UPU9 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SAMD4AQ9UPU9 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SAMD4AQ9UPU9 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SAMD4AQ9UPU9 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SAMD4AQ9UPU9 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SAMD4AQ9UPU9 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SAMD4AQ9UPU9 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SAMD4AQ9UPU9 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SAMD4AQ9UPU9 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SAMD4AQ9UPU9 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SAMD4AQ9UPU9 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SAMD4AQ9UPU9 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SAMD4AQ9UPU9 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SAMD4AQ9UPU9 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SAMD4AQ9UPU9 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SAMD4AQ9UPU9 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SAMD4AQ9UPU9 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SAMD4AQ9UPU9 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SAMD4AQ9UPU9 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SAMD4AQ9UPU9 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
SAMD4AQ9UPU9 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SAMD4AQ9UPU9 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SAMD4AQ9UPU9 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SAMD4AQ9UPU9 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SAMD4AQ9UPU9 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SAMD4AQ9UPU9 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SAMD4AQ9UPU9 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SAMD4AQ9UPU9 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SAMD4AQ9UPU9 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SAMD4AQ9UPU9 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SAMD4AQ9UPU9 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SAMD4AQ9UPU9 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SAMD4AQ9UPU9 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SAMD4AQ9UPU9 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SAMD4AQ9UPU9 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SAMD4AQ9UPU9 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SAMD4AQ9UPU9 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SAMD4AQ9UPU9 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SAMD4AQ9UPU9 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SAMD4AQ9UPU9 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SAMD4AQ9UPU9 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SAMD4AQ9UPU9 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SAMD4AQ9UPU9 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SAMD4AQ9UPU9 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SAMD4AQ9UPU9 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SAMD4AQ9UPU9 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SAMD4AQ9UPU9 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SAMD4AQ9UPU9 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SAMD4AQ9UPU9 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SAMD4AQ9UPU9 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SAMD4AQ9UPU9 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SAMD4AQ9UPU9 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SAMD4AQ9UPU9 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SAMD4AQ9UPU9 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
SAMD4AQ9UPU9 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SAMD4AQ9UPU9 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SAMD4AQ9UPU9 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SAMD4AQ9UPU9 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SAMD4AQ9UPU9 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SAMD4AQ9UPU9 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SAMD4AQ9UPU9 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SAMD4AQ9UPU9 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SAMD4AQ9UPU9 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms