Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ9

TNRC6B, Trinucleotide repeat-containing gene 6B protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNRC6BQ9UPQ9 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TNRC6BQ9UPQ9 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TNRC6BQ9UPQ9 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TNRC6BQ9UPQ9 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TNRC6BQ9UPQ9 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TNRC6BQ9UPQ9 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
TNRC6BQ9UPQ9 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
TNRC6BQ9UPQ9 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TNRC6BQ9UPQ9 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TNRC6BQ9UPQ9 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
TNRC6BQ9UPQ9 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
TNRC6BQ9UPQ9 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
TNRC6BQ9UPQ9 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TNRC6BQ9UPQ9 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
TNRC6BQ9UPQ9 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
TNRC6BQ9UPQ9 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
TNRC6BQ9UPQ9 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TNRC6BQ9UPQ9 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TNRC6BQ9UPQ9 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TNRC6BQ9UPQ9 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TNRC6BQ9UPQ9 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TNRC6BQ9UPQ9 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TNRC6BQ9UPQ9 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TNRC6BQ9UPQ9 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TNRC6BQ9UPQ9 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TNRC6BQ9UPQ9 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TNRC6BQ9UPQ9 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TNRC6BQ9UPQ9 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TNRC6BQ9UPQ9 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TNRC6BQ9UPQ9 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TNRC6BQ9UPQ9 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TNRC6BQ9UPQ9 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TNRC6BQ9UPQ9 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TNRC6BQ9UPQ9 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TNRC6BQ9UPQ9 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TNRC6BQ9UPQ9 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TNRC6BQ9UPQ9 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TNRC6BQ9UPQ9 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TNRC6BQ9UPQ9 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TNRC6BQ9UPQ9 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TNRC6BQ9UPQ9 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TNRC6BQ9UPQ9 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TNRC6BQ9UPQ9 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TNRC6BQ9UPQ9 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TNRC6BQ9UPQ9 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TNRC6BQ9UPQ9 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TNRC6BQ9UPQ9 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNRC6BQ9UPQ9 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNRC6BQ9UPQ9 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNRC6BQ9UPQ9 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TNRC6BQ9UPQ9 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNRC6BQ9UPQ9 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNRC6BQ9UPQ9 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNRC6BQ9UPQ9 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNRC6BQ9UPQ9 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNRC6BQ9UPQ9 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNRC6BQ9UPQ9 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNRC6BQ9UPQ9 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNRC6BQ9UPQ9 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNRC6BQ9UPQ9 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNRC6BQ9UPQ9 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNRC6BQ9UPQ9 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNRC6BQ9UPQ9 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNRC6BQ9UPQ9 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNRC6BQ9UPQ9 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNRC6BQ9UPQ9 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNRC6BQ9UPQ9 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNRC6BQ9UPQ9 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TNRC6BQ9UPQ9 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNRC6BQ9UPQ9 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNRC6BQ9UPQ9 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNRC6BQ9UPQ9 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNRC6BQ9UPQ9 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNRC6BQ9UPQ9 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TNRC6BQ9UPQ9 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNRC6BQ9UPQ9 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TNRC6BQ9UPQ9 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNRC6BQ9UPQ9 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNRC6BQ9UPQ9 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNRC6BQ9UPQ9 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNRC6BQ9UPQ9 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNRC6BQ9UPQ9 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNRC6BQ9UPQ9 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNRC6BQ9UPQ9 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNRC6BQ9UPQ9 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNRC6BQ9UPQ9 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNRC6BQ9UPQ9 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNRC6BQ9UPQ9 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNRC6BQ9UPQ9 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNRC6BQ9UPQ9 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TNRC6BQ9UPQ9 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TNRC6BQ9UPQ9 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNRC6BQ9UPQ9 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNRC6BQ9UPQ9 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNRC6BQ9UPQ9 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNRC6BQ9UPQ9 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNRC6BQ9UPQ9 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNRC6BQ9UPQ9 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNRC6BQ9UPQ9 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNRC6BQ9UPQ9 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.1 ms