Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNY4

TTF2, Transcription termination factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF2Q9UNY4 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TTF2Q9UNY4 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TTF2Q9UNY4 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TTF2Q9UNY4 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TTF2Q9UNY4 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TTF2Q9UNY4 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TTF2Q9UNY4 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TTF2Q9UNY4 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TTF2Q9UNY4 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TTF2Q9UNY4 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TTF2Q9UNY4 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TTF2Q9UNY4 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TTF2Q9UNY4 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TTF2Q9UNY4 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TTF2Q9UNY4 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TTF2Q9UNY4 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TTF2Q9UNY4 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TTF2Q9UNY4 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TTF2Q9UNY4 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TTF2Q9UNY4 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TTF2Q9UNY4 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TTF2Q9UNY4 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TTF2Q9UNY4 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TTF2Q9UNY4 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TTF2Q9UNY4 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TTF2Q9UNY4 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TTF2Q9UNY4 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TTF2Q9UNY4 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TTF2Q9UNY4 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TTF2Q9UNY4 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TTF2Q9UNY4 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TTF2Q9UNY4 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TTF2Q9UNY4 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TTF2Q9UNY4 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TTF2Q9UNY4 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TTF2Q9UNY4 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TTF2Q9UNY4 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TTF2Q9UNY4 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TTF2Q9UNY4 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TTF2Q9UNY4 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TTF2Q9UNY4 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TTF2Q9UNY4 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TTF2Q9UNY4 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TTF2Q9UNY4 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TTF2Q9UNY4 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TTF2Q9UNY4 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TTF2Q9UNY4 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TTF2Q9UNY4 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TTF2Q9UNY4 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TTF2Q9UNY4 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TTF2Q9UNY4 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TTF2Q9UNY4 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TTF2Q9UNY4 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TTF2Q9UNY4 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TTF2Q9UNY4 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TTF2Q9UNY4 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TTF2Q9UNY4 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TTF2Q9UNY4 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TTF2Q9UNY4 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TTF2Q9UNY4 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TTF2Q9UNY4 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TTF2Q9UNY4 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TTF2Q9UNY4 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TTF2Q9UNY4 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TTF2Q9UNY4 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TTF2Q9UNY4 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TTF2Q9UNY4 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TTF2Q9UNY4 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TTF2Q9UNY4 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TTF2Q9UNY4 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TTF2Q9UNY4 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TTF2Q9UNY4 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TTF2Q9UNY4 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TTF2Q9UNY4 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TTF2Q9UNY4 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TTF2Q9UNY4 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TTF2Q9UNY4 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TTF2Q9UNY4 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TTF2Q9UNY4 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TTF2Q9UNY4 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TTF2Q9UNY4 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TTF2Q9UNY4 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TTF2Q9UNY4 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TTF2Q9UNY4 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TTF2Q9UNY4 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TTF2Q9UNY4 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TTF2Q9UNY4 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TTF2Q9UNY4 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TTF2Q9UNY4 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TTF2Q9UNY4 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TTF2Q9UNY4 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TTF2Q9UNY4 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TTF2Q9UNY4 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TTF2Q9UNY4 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TTF2Q9UNY4 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TTF2Q9UNY4 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TTF2Q9UNY4 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TTF2Q9UNY4 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TTF2Q9UNY4 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TTF2Q9UNY4 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms