Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNH6

SNX7, Sorting nexin-7, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX7Q9UNH6 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNX7Q9UNH6 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNX7Q9UNH6 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNX7Q9UNH6 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNX7Q9UNH6 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SNX7Q9UNH6 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNX7Q9UNH6 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNX7Q9UNH6 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SNX7Q9UNH6 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNX7Q9UNH6 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SNX7Q9UNH6 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNX7Q9UNH6 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNX7Q9UNH6 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNX7Q9UNH6 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SNX7Q9UNH6 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNX7Q9UNH6 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNX7Q9UNH6 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNX7Q9UNH6 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SNX7Q9UNH6 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SNX7Q9UNH6 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNX7Q9UNH6 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNX7Q9UNH6 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNX7Q9UNH6 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
SNX7Q9UNH6 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
SNX7Q9UNH6 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
SNX7Q9UNH6 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNX7Q9UNH6 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNX7Q9UNH6 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNX7Q9UNH6 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNX7Q9UNH6 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNX7Q9UNH6 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNX7Q9UNH6 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNX7Q9UNH6 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNX7Q9UNH6 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNX7Q9UNH6 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNX7Q9UNH6 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNX7Q9UNH6 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNX7Q9UNH6 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNX7Q9UNH6 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNX7Q9UNH6 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNX7Q9UNH6 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNX7Q9UNH6 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNX7Q9UNH6 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNX7Q9UNH6 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNX7Q9UNH6 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNX7Q9UNH6 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNX7Q9UNH6 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNX7Q9UNH6 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNX7Q9UNH6 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNX7Q9UNH6 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNX7Q9UNH6 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNX7Q9UNH6 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNX7Q9UNH6 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNX7Q9UNH6 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNX7Q9UNH6 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNX7Q9UNH6 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNX7Q9UNH6 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNX7Q9UNH6 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNX7Q9UNH6 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNX7Q9UNH6 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNX7Q9UNH6 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNX7Q9UNH6 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNX7Q9UNH6 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNX7Q9UNH6 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNX7Q9UNH6 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNX7Q9UNH6 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNX7Q9UNH6 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNX7Q9UNH6 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNX7Q9UNH6 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNX7Q9UNH6 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SNX7Q9UNH6 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNX7Q9UNH6 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNX7Q9UNH6 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNX7Q9UNH6 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNX7Q9UNH6 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNX7Q9UNH6 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNX7Q9UNH6 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNX7Q9UNH6 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNX7Q9UNH6 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNX7Q9UNH6 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNX7Q9UNH6 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNX7Q9UNH6 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNX7Q9UNH6 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNX7Q9UNH6 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNX7Q9UNH6 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SNX7Q9UNH6 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNX7Q9UNH6 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNX7Q9UNH6 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNX7Q9UNH6 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNX7Q9UNH6 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SNX7Q9UNH6 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNX7Q9UNH6 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNX7Q9UNH6 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNX7Q9UNH6 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNX7Q9UNH6 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNX7Q9UNH6 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNX7Q9UNH6 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNX7Q9UNH6 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SNX7Q9UNH6 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SNX7Q9UNH6 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms