Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMY4

SNX12, Sorting nexin-12, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX12Q9UMY4 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SNX12Q9UMY4 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SNX12Q9UMY4 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SNX12Q9UMY4 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
SNX12Q9UMY4 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SNX12Q9UMY4 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SNX12Q9UMY4 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SNX12Q9UMY4 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SNX12Q9UMY4 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SNX12Q9UMY4 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SNX12Q9UMY4 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SNX12Q9UMY4 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SNX12Q9UMY4 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SNX12Q9UMY4 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SNX12Q9UMY4 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SNX12Q9UMY4 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SNX12Q9UMY4 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SNX12Q9UMY4 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SNX12Q9UMY4 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SNX12Q9UMY4 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SNX12Q9UMY4 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SNX12Q9UMY4 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SNX12Q9UMY4 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SNX12Q9UMY4 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SNX12Q9UMY4 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SNX12Q9UMY4 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SNX12Q9UMY4 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SNX12Q9UMY4 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SNX12Q9UMY4 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SNX12Q9UMY4 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SNX12Q9UMY4 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SNX12Q9UMY4 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SNX12Q9UMY4 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SNX12Q9UMY4 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SNX12Q9UMY4 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SNX12Q9UMY4 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SNX12Q9UMY4 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SNX12Q9UMY4 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SNX12Q9UMY4 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SNX12Q9UMY4 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
SNX12Q9UMY4 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SNX12Q9UMY4 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SNX12Q9UMY4 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SNX12Q9UMY4 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SNX12Q9UMY4 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SNX12Q9UMY4 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SNX12Q9UMY4 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SNX12Q9UMY4 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SNX12Q9UMY4 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SNX12Q9UMY4 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SNX12Q9UMY4 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
SNX12Q9UMY4 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SNX12Q9UMY4 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SNX12Q9UMY4 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SNX12Q9UMY4 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SNX12Q9UMY4 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SNX12Q9UMY4 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SNX12Q9UMY4 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SNX12Q9UMY4 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SNX12Q9UMY4 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SNX12Q9UMY4 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
SNX12Q9UMY4 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SNX12Q9UMY4 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SNX12Q9UMY4 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SNX12Q9UMY4 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SNX12Q9UMY4 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SNX12Q9UMY4 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SNX12Q9UMY4 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SNX12Q9UMY4 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
SNX12Q9UMY4 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SNX12Q9UMY4 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SNX12Q9UMY4 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SNX12Q9UMY4 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SNX12Q9UMY4 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SNX12Q9UMY4 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.75
SNX12Q9UMY4 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.75
SNX12Q9UMY4 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
SNX12Q9UMY4 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
SNX12Q9UMY4 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SNX12Q9UMY4 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SNX12Q9UMY4 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SNX12Q9UMY4 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SNX12Q9UMY4 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SNX12Q9UMY4 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SNX12Q9UMY4 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SNX12Q9UMY4 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SNX12Q9UMY4 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SNX12Q9UMY4 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SNX12Q9UMY4 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SNX12Q9UMY4 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SNX12Q9UMY4 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SNX12Q9UMY4 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SNX12Q9UMY4 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SNX12Q9UMY4 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SNX12Q9UMY4 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SNX12Q9UMY4 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SNX12Q9UMY4 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SNX12Q9UMY4 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SNX12Q9UMY4 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
SNX12Q9UMY4 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms