Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULE3

DENND2A, DENN domain-containing protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENND2AQ9ULE3 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DENND2AQ9ULE3 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DENND2AQ9ULE3 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DENND2AQ9ULE3 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DENND2AQ9ULE3 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DENND2AQ9ULE3 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
DENND2AQ9ULE3 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DENND2AQ9ULE3 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DENND2AQ9ULE3 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DENND2AQ9ULE3 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DENND2AQ9ULE3 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DENND2AQ9ULE3 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DENND2AQ9ULE3 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DENND2AQ9ULE3 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
DENND2AQ9ULE3 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DENND2AQ9ULE3 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DENND2AQ9ULE3 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DENND2AQ9ULE3 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DENND2AQ9ULE3 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DENND2AQ9ULE3 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DENND2AQ9ULE3 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DENND2AQ9ULE3 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
DENND2AQ9ULE3 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DENND2AQ9ULE3 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DENND2AQ9ULE3 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DENND2AQ9ULE3 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DENND2AQ9ULE3 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DENND2AQ9ULE3 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DENND2AQ9ULE3 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DENND2AQ9ULE3 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DENND2AQ9ULE3 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DENND2AQ9ULE3 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DENND2AQ9ULE3 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DENND2AQ9ULE3 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
DENND2AQ9ULE3 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DENND2AQ9ULE3 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DENND2AQ9ULE3 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DENND2AQ9ULE3 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DENND2AQ9ULE3 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DENND2AQ9ULE3 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DENND2AQ9ULE3 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DENND2AQ9ULE3 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DENND2AQ9ULE3 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DENND2AQ9ULE3 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DENND2AQ9ULE3 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DENND2AQ9ULE3 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DENND2AQ9ULE3 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DENND2AQ9ULE3 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
DENND2AQ9ULE3 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
DENND2AQ9ULE3 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DENND2AQ9ULE3 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DENND2AQ9ULE3 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DENND2AQ9ULE3 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DENND2AQ9ULE3 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DENND2AQ9ULE3 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DENND2AQ9ULE3 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
DENND2AQ9ULE3 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DENND2AQ9ULE3 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DENND2AQ9ULE3 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DENND2AQ9ULE3 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DENND2AQ9ULE3 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DENND2AQ9ULE3 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DENND2AQ9ULE3 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DENND2AQ9ULE3 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DENND2AQ9ULE3 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DENND2AQ9ULE3 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DENND2AQ9ULE3 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DENND2AQ9ULE3 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DENND2AQ9ULE3 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DENND2AQ9ULE3 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DENND2AQ9ULE3 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DENND2AQ9ULE3 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DENND2AQ9ULE3 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DENND2AQ9ULE3 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
DENND2AQ9ULE3 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DENND2AQ9ULE3 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DENND2AQ9ULE3 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DENND2AQ9ULE3 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DENND2AQ9ULE3 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DENND2AQ9ULE3 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DENND2AQ9ULE3 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DENND2AQ9ULE3 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DENND2AQ9ULE3 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DENND2AQ9ULE3 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DENND2AQ9ULE3 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DENND2AQ9ULE3 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DENND2AQ9ULE3 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DENND2AQ9ULE3 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DENND2AQ9ULE3 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DENND2AQ9ULE3 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
DENND2AQ9ULE3 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
DENND2AQ9ULE3 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
DENND2AQ9ULE3 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DENND2AQ9ULE3 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DENND2AQ9ULE3 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DENND2AQ9ULE3 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DENND2AQ9ULE3 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DENND2AQ9ULE3 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
DENND2AQ9ULE3 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DENND2AQ9ULE3 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms