Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKV0

HDAC9, Histone deacetylase 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,011 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC9Q9UKV0 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HDAC9Q9UKV0 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HDAC9Q9UKV0 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HDAC9Q9UKV0 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HDAC9Q9UKV0 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HDAC9Q9UKV0 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HDAC9Q9UKV0 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HDAC9Q9UKV0 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
HDAC9Q9UKV0 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
HDAC9Q9UKV0 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HDAC9Q9UKV0 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HDAC9Q9UKV0 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HDAC9Q9UKV0 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HDAC9Q9UKV0 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HDAC9Q9UKV0 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HDAC9Q9UKV0 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HDAC9Q9UKV0 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HDAC9Q9UKV0 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HDAC9Q9UKV0 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HDAC9Q9UKV0 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HDAC9Q9UKV0 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HDAC9Q9UKV0 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HDAC9Q9UKV0 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HDAC9Q9UKV0 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
HDAC9Q9UKV0 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HDAC9Q9UKV0 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HDAC9Q9UKV0 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HDAC9Q9UKV0 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HDAC9Q9UKV0 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HDAC9Q9UKV0 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HDAC9Q9UKV0 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HDAC9Q9UKV0 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HDAC9Q9UKV0 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HDAC9Q9UKV0 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HDAC9Q9UKV0 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HDAC9Q9UKV0 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HDAC9Q9UKV0 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HDAC9Q9UKV0 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HDAC9Q9UKV0 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HDAC9Q9UKV0 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HDAC9Q9UKV0 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HDAC9Q9UKV0 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HDAC9Q9UKV0 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HDAC9Q9UKV0 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HDAC9Q9UKV0 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
HDAC9Q9UKV0 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HDAC9Q9UKV0 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HDAC9Q9UKV0 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
HDAC9Q9UKV0 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HDAC9Q9UKV0 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HDAC9Q9UKV0 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HDAC9Q9UKV0 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HDAC9Q9UKV0 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HDAC9Q9UKV0 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HDAC9Q9UKV0 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HDAC9Q9UKV0 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
HDAC9Q9UKV0 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
HDAC9Q9UKV0 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HDAC9Q9UKV0 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HDAC9Q9UKV0 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HDAC9Q9UKV0 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HDAC9Q9UKV0 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HDAC9Q9UKV0 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HDAC9Q9UKV0 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HDAC9Q9UKV0 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HDAC9Q9UKV0 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
HDAC9Q9UKV0 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HDAC9Q9UKV0 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HDAC9Q9UKV0 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
HDAC9Q9UKV0 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HDAC9Q9UKV0 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HDAC9Q9UKV0 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HDAC9Q9UKV0 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HDAC9Q9UKV0 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HDAC9Q9UKV0 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HDAC9Q9UKV0 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HDAC9Q9UKV0 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HDAC9Q9UKV0 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
HDAC9Q9UKV0 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HDAC9Q9UKV0 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HDAC9Q9UKV0 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HDAC9Q9UKV0 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HDAC9Q9UKV0 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HDAC9Q9UKV0 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
HDAC9Q9UKV0 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HDAC9Q9UKV0 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HDAC9Q9UKV0 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HDAC9Q9UKV0 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HDAC9Q9UKV0 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HDAC9Q9UKV0 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HDAC9Q9UKV0 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HDAC9Q9UKV0 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HDAC9Q9UKV0 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HDAC9Q9UKV0 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
HDAC9Q9UKV0 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
HDAC9Q9UKV0 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HDAC9Q9UKV0 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HDAC9Q9UKV0 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HDAC9Q9UKV0 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HDAC9Q9UKV0 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms