Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKL3

CASP8AP2, CASP8-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,982 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP8AP2Q9UKL3 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CASP8AP2Q9UKL3 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CASP8AP2Q9UKL3 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CASP8AP2Q9UKL3 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CASP8AP2Q9UKL3 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CASP8AP2Q9UKL3 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CASP8AP2Q9UKL3 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CASP8AP2Q9UKL3 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CASP8AP2Q9UKL3 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CASP8AP2Q9UKL3 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CASP8AP2Q9UKL3 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CASP8AP2Q9UKL3 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CASP8AP2Q9UKL3 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CASP8AP2Q9UKL3 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CASP8AP2Q9UKL3 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CASP8AP2Q9UKL3 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CASP8AP2Q9UKL3 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CASP8AP2Q9UKL3 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CASP8AP2Q9UKL3 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CASP8AP2Q9UKL3 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CASP8AP2Q9UKL3 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CASP8AP2Q9UKL3 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CASP8AP2Q9UKL3 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CASP8AP2Q9UKL3 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CASP8AP2Q9UKL3 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CASP8AP2Q9UKL3 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CASP8AP2Q9UKL3 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CASP8AP2Q9UKL3 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CASP8AP2Q9UKL3 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CASP8AP2Q9UKL3 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CASP8AP2Q9UKL3 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CASP8AP2Q9UKL3 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CASP8AP2Q9UKL3 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CASP8AP2Q9UKL3 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CASP8AP2Q9UKL3 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CASP8AP2Q9UKL3 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CASP8AP2Q9UKL3 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CASP8AP2Q9UKL3 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CASP8AP2Q9UKL3 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CASP8AP2Q9UKL3 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CASP8AP2Q9UKL3 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CASP8AP2Q9UKL3 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CASP8AP2Q9UKL3 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CASP8AP2Q9UKL3 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CASP8AP2Q9UKL3 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CASP8AP2Q9UKL3 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CASP8AP2Q9UKL3 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CASP8AP2Q9UKL3 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CASP8AP2Q9UKL3 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CASP8AP2Q9UKL3 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CASP8AP2Q9UKL3 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CASP8AP2Q9UKL3 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CASP8AP2Q9UKL3 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CASP8AP2Q9UKL3 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CASP8AP2Q9UKL3 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CASP8AP2Q9UKL3 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CASP8AP2Q9UKL3 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CASP8AP2Q9UKL3 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CASP8AP2Q9UKL3 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CASP8AP2Q9UKL3 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CASP8AP2Q9UKL3 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CASP8AP2Q9UKL3 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CASP8AP2Q9UKL3 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CASP8AP2Q9UKL3 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CASP8AP2Q9UKL3 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CASP8AP2Q9UKL3 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CASP8AP2Q9UKL3 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CASP8AP2Q9UKL3 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CASP8AP2Q9UKL3 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CASP8AP2Q9UKL3 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CASP8AP2Q9UKL3 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CASP8AP2Q9UKL3 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CASP8AP2Q9UKL3 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CASP8AP2Q9UKL3 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CASP8AP2Q9UKL3 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CASP8AP2Q9UKL3 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CASP8AP2Q9UKL3 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CASP8AP2Q9UKL3 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CASP8AP2Q9UKL3 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CASP8AP2Q9UKL3 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CASP8AP2Q9UKL3 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CASP8AP2Q9UKL3 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CASP8AP2Q9UKL3 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CASP8AP2Q9UKL3 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CASP8AP2Q9UKL3 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CASP8AP2Q9UKL3 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CASP8AP2Q9UKL3 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CASP8AP2Q9UKL3 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CASP8AP2Q9UKL3 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CASP8AP2Q9UKL3 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CASP8AP2Q9UKL3 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CASP8AP2Q9UKL3 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CASP8AP2Q9UKL3 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CASP8AP2Q9UKL3 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CASP8AP2Q9UKL3 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CASP8AP2Q9UKL3 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CASP8AP2Q9UKL3 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CASP8AP2Q9UKL3 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CASP8AP2Q9UKL3 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CASP8AP2Q9UKL3 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms