Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK80

USP21, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 21, humanhuman

Predictions only

Length 565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP21Q9UK80 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP21Q9UK80 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP21Q9UK80 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP21Q9UK80 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP21Q9UK80 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP21Q9UK80 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP21Q9UK80 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP21Q9UK80 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP21Q9UK80 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP21Q9UK80 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP21Q9UK80 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP21Q9UK80 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP21Q9UK80 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP21Q9UK80 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
USP21Q9UK80 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
USP21Q9UK80 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
USP21Q9UK80 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
USP21Q9UK80 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
USP21Q9UK80 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
USP21Q9UK80 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
USP21Q9UK80 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
USP21Q9UK80 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
USP21Q9UK80 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
USP21Q9UK80 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
USP21Q9UK80 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
USP21Q9UK80 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
USP21Q9UK80 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
USP21Q9UK80 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
USP21Q9UK80 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
USP21Q9UK80 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
USP21Q9UK80 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
USP21Q9UK80 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
USP21Q9UK80 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
USP21Q9UK80 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
USP21Q9UK80 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
USP21Q9UK80 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
USP21Q9UK80 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
USP21Q9UK80 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
USP21Q9UK80 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
USP21Q9UK80 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
USP21Q9UK80 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
USP21Q9UK80 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
USP21Q9UK80 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
USP21Q9UK80 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
USP21Q9UK80 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
USP21Q9UK80 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
USP21Q9UK80 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
USP21Q9UK80 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
USP21Q9UK80 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
USP21Q9UK80 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
USP21Q9UK80 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
USP21Q9UK80 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
USP21Q9UK80 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
USP21Q9UK80 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP21Q9UK80 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP21Q9UK80 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP21Q9UK80 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP21Q9UK80 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP21Q9UK80 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP21Q9UK80 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP21Q9UK80 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP21Q9UK80 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP21Q9UK80 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
USP21Q9UK80 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP21Q9UK80 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP21Q9UK80 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP21Q9UK80 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP21Q9UK80 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP21Q9UK80 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP21Q9UK80 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP21Q9UK80 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP21Q9UK80 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP21Q9UK80 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP21Q9UK80 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP21Q9UK80 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP21Q9UK80 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
USP21Q9UK80 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP21Q9UK80 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP21Q9UK80 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP21Q9UK80 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP21Q9UK80 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP21Q9UK80 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP21Q9UK80 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP21Q9UK80 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
USP21Q9UK80 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP21Q9UK80 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
USP21Q9UK80 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP21Q9UK80 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP21Q9UK80 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP21Q9UK80 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP21Q9UK80 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP21Q9UK80 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
USP21Q9UK80 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
USP21Q9UK80 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
USP21Q9UK80 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
USP21Q9UK80 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
USP21Q9UK80 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
USP21Q9UK80 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
USP21Q9UK80 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
USP21Q9UK80 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms