Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI42

CPA4, Carboxypeptidase A4, humanhuman

Predictions only

Length 421 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPA4Q9UI42 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CPA4Q9UI42 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CPA4Q9UI42 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CPA4Q9UI42 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CPA4Q9UI42 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CPA4Q9UI42 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CPA4Q9UI42 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CPA4Q9UI42 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CPA4Q9UI42 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CPA4Q9UI42 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CPA4Q9UI42 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CPA4Q9UI42 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CPA4Q9UI42 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CPA4Q9UI42 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CPA4Q9UI42 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CPA4Q9UI42 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CPA4Q9UI42 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CPA4Q9UI42 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CPA4Q9UI42 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CPA4Q9UI42 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CPA4Q9UI42 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CPA4Q9UI42 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CPA4Q9UI42 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CPA4Q9UI42 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CPA4Q9UI42 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CPA4Q9UI42 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CPA4Q9UI42 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CPA4Q9UI42 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CPA4Q9UI42 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CPA4Q9UI42 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CPA4Q9UI42 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CPA4Q9UI42 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CPA4Q9UI42 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CPA4Q9UI42 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CPA4Q9UI42 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CPA4Q9UI42 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CPA4Q9UI42 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CPA4Q9UI42 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CPA4Q9UI42 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CPA4Q9UI42 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CPA4Q9UI42 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CPA4Q9UI42 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CPA4Q9UI42 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CPA4Q9UI42 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CPA4Q9UI42 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CPA4Q9UI42 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CPA4Q9UI42 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CPA4Q9UI42 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CPA4Q9UI42 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CPA4Q9UI42 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CPA4Q9UI42 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CPA4Q9UI42 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CPA4Q9UI42 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CPA4Q9UI42 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CPA4Q9UI42 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CPA4Q9UI42 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CPA4Q9UI42 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CPA4Q9UI42 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CPA4Q9UI42 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CPA4Q9UI42 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CPA4Q9UI42 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CPA4Q9UI42 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CPA4Q9UI42 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CPA4Q9UI42 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CPA4Q9UI42 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CPA4Q9UI42 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CPA4Q9UI42 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CPA4Q9UI42 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CPA4Q9UI42 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CPA4Q9UI42 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CPA4Q9UI42 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CPA4Q9UI42 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CPA4Q9UI42 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CPA4Q9UI42 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CPA4Q9UI42 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CPA4Q9UI42 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CPA4Q9UI42 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CPA4Q9UI42 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CPA4Q9UI42 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CPA4Q9UI42 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CPA4Q9UI42 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CPA4Q9UI42 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CPA4Q9UI42 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CPA4Q9UI42 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CPA4Q9UI42 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CPA4Q9UI42 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CPA4Q9UI42 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CPA4Q9UI42 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CPA4Q9UI42 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CPA4Q9UI42 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CPA4Q9UI42 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CPA4Q9UI42 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CPA4Q9UI42 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CPA4Q9UI42 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CPA4Q9UI42 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CPA4Q9UI42 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CPA4Q9UI42 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CPA4Q9UI42 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CPA4Q9UI42 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CPA4Q9UI42 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
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