Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGQ2

CACFD1, Calcium channel flower homolog, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACFD1Q9UGQ2 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CACFD1Q9UGQ2 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CACFD1Q9UGQ2 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CACFD1Q9UGQ2 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CACFD1Q9UGQ2 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CACFD1Q9UGQ2 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CACFD1Q9UGQ2 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CACFD1Q9UGQ2 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CACFD1Q9UGQ2 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CACFD1Q9UGQ2 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CACFD1Q9UGQ2 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CACFD1Q9UGQ2 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CACFD1Q9UGQ2 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CACFD1Q9UGQ2 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CACFD1Q9UGQ2 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CACFD1Q9UGQ2 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CACFD1Q9UGQ2 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CACFD1Q9UGQ2 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CACFD1Q9UGQ2 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CACFD1Q9UGQ2 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CACFD1Q9UGQ2 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CACFD1Q9UGQ2 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CACFD1Q9UGQ2 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CACFD1Q9UGQ2 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CACFD1Q9UGQ2 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CACFD1Q9UGQ2 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CACFD1Q9UGQ2 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CACFD1Q9UGQ2 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CACFD1Q9UGQ2 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CACFD1Q9UGQ2 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CACFD1Q9UGQ2 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CACFD1Q9UGQ2 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CACFD1Q9UGQ2 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CACFD1Q9UGQ2 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CACFD1Q9UGQ2 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CACFD1Q9UGQ2 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CACFD1Q9UGQ2 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CACFD1Q9UGQ2 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CACFD1Q9UGQ2 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CACFD1Q9UGQ2 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CACFD1Q9UGQ2 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CACFD1Q9UGQ2 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CACFD1Q9UGQ2 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CACFD1Q9UGQ2 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CACFD1Q9UGQ2 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CACFD1Q9UGQ2 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CACFD1Q9UGQ2 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CACFD1Q9UGQ2 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CACFD1Q9UGQ2 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CACFD1Q9UGQ2 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CACFD1Q9UGQ2 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CACFD1Q9UGQ2 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CACFD1Q9UGQ2 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CACFD1Q9UGQ2 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CACFD1Q9UGQ2 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CACFD1Q9UGQ2 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CACFD1Q9UGQ2 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CACFD1Q9UGQ2 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CACFD1Q9UGQ2 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CACFD1Q9UGQ2 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CACFD1Q9UGQ2 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CACFD1Q9UGQ2 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CACFD1Q9UGQ2 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CACFD1Q9UGQ2 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CACFD1Q9UGQ2 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CACFD1Q9UGQ2 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CACFD1Q9UGQ2 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CACFD1Q9UGQ2 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CACFD1Q9UGQ2 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CACFD1Q9UGQ2 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CACFD1Q9UGQ2 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CACFD1Q9UGQ2 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CACFD1Q9UGQ2 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CACFD1Q9UGQ2 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CACFD1Q9UGQ2 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CACFD1Q9UGQ2 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CACFD1Q9UGQ2 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CACFD1Q9UGQ2 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CACFD1Q9UGQ2 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CACFD1Q9UGQ2 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CACFD1Q9UGQ2 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CACFD1Q9UGQ2 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CACFD1Q9UGQ2 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CACFD1Q9UGQ2 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CACFD1Q9UGQ2 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CACFD1Q9UGQ2 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CACFD1Q9UGQ2 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CACFD1Q9UGQ2 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CACFD1Q9UGQ2 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CACFD1Q9UGQ2 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CACFD1Q9UGQ2 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CACFD1Q9UGQ2 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CACFD1Q9UGQ2 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CACFD1Q9UGQ2 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CACFD1Q9UGQ2 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CACFD1Q9UGQ2 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CACFD1Q9UGQ2 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CACFD1Q9UGQ2 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CACFD1Q9UGQ2 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CACFD1Q9UGQ2 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms