Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG63

ABCF2, ATP-binding cassette sub-family F member 2, humanhuman

Predictions only

Length 623 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCF2Q9UG63 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ABCF2Q9UG63 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ABCF2Q9UG63 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ABCF2Q9UG63 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ABCF2Q9UG63 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ABCF2Q9UG63 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ABCF2Q9UG63 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ABCF2Q9UG63 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ABCF2Q9UG63 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ABCF2Q9UG63 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ABCF2Q9UG63 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ABCF2Q9UG63 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ABCF2Q9UG63 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ABCF2Q9UG63 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ABCF2Q9UG63 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ABCF2Q9UG63 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ABCF2Q9UG63 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ABCF2Q9UG63 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ABCF2Q9UG63 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ABCF2Q9UG63 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ABCF2Q9UG63 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ABCF2Q9UG63 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ABCF2Q9UG63 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ABCF2Q9UG63 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ABCF2Q9UG63 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ABCF2Q9UG63 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ABCF2Q9UG63 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ABCF2Q9UG63 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ABCF2Q9UG63 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ABCF2Q9UG63 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ABCF2Q9UG63 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ABCF2Q9UG63 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ABCF2Q9UG63 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ABCF2Q9UG63 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ABCF2Q9UG63 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ABCF2Q9UG63 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ABCF2Q9UG63 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ABCF2Q9UG63 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ABCF2Q9UG63 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ABCF2Q9UG63 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ABCF2Q9UG63 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ABCF2Q9UG63 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ABCF2Q9UG63 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ABCF2Q9UG63 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ABCF2Q9UG63 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ABCF2Q9UG63 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ABCF2Q9UG63 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ABCF2Q9UG63 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ABCF2Q9UG63 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ABCF2Q9UG63 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ABCF2Q9UG63 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ABCF2Q9UG63 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ABCF2Q9UG63 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ABCF2Q9UG63 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ABCF2Q9UG63 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ABCF2Q9UG63 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ABCF2Q9UG63 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ABCF2Q9UG63 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ABCF2Q9UG63 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ABCF2Q9UG63 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ABCF2Q9UG63 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ABCF2Q9UG63 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ABCF2Q9UG63 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ABCF2Q9UG63 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ABCF2Q9UG63 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ABCF2Q9UG63 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ABCF2Q9UG63 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ABCF2Q9UG63 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ABCF2Q9UG63 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ABCF2Q9UG63 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ABCF2Q9UG63 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ABCF2Q9UG63 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ABCF2Q9UG63 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ABCF2Q9UG63 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
ABCF2Q9UG63 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ABCF2Q9UG63 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ABCF2Q9UG63 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ABCF2Q9UG63 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ABCF2Q9UG63 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ABCF2Q9UG63 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ABCF2Q9UG63 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ABCF2Q9UG63 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ABCF2Q9UG63 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ABCF2Q9UG63 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ABCF2Q9UG63 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ABCF2Q9UG63 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ABCF2Q9UG63 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ABCF2Q9UG63 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ABCF2Q9UG63 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ABCF2Q9UG63 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ABCF2Q9UG63 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ABCF2Q9UG63 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ABCF2Q9UG63 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ABCF2Q9UG63 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ABCF2Q9UG63 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ABCF2Q9UG63 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ABCF2Q9UG63 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ABCF2Q9UG63 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ABCF2Q9UG63 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ABCF2Q9UG63 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms