Protein–RNA interactions for Protein: Q9UEU0

VTI1B, Vesicle transport through interaction with t-SNAREs homolog 1B, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTI1BQ9UEU0 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VTI1BQ9UEU0 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VTI1BQ9UEU0 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VTI1BQ9UEU0 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VTI1BQ9UEU0 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
VTI1BQ9UEU0 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
VTI1BQ9UEU0 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VTI1BQ9UEU0 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
VTI1BQ9UEU0 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
VTI1BQ9UEU0 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
VTI1BQ9UEU0 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VTI1BQ9UEU0 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VTI1BQ9UEU0 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VTI1BQ9UEU0 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
VTI1BQ9UEU0 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
VTI1BQ9UEU0 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VTI1BQ9UEU0 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VTI1BQ9UEU0 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VTI1BQ9UEU0 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VTI1BQ9UEU0 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VTI1BQ9UEU0 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VTI1BQ9UEU0 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VTI1BQ9UEU0 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
VTI1BQ9UEU0 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VTI1BQ9UEU0 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VTI1BQ9UEU0 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
VTI1BQ9UEU0 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VTI1BQ9UEU0 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VTI1BQ9UEU0 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VTI1BQ9UEU0 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VTI1BQ9UEU0 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VTI1BQ9UEU0 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
VTI1BQ9UEU0 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
VTI1BQ9UEU0 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
VTI1BQ9UEU0 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
VTI1BQ9UEU0 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
VTI1BQ9UEU0 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VTI1BQ9UEU0 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
VTI1BQ9UEU0 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
VTI1BQ9UEU0 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
VTI1BQ9UEU0 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VTI1BQ9UEU0 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
VTI1BQ9UEU0 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
VTI1BQ9UEU0 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VTI1BQ9UEU0 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
VTI1BQ9UEU0 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VTI1BQ9UEU0 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
VTI1BQ9UEU0 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
VTI1BQ9UEU0 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
VTI1BQ9UEU0 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VTI1BQ9UEU0 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
VTI1BQ9UEU0 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
VTI1BQ9UEU0 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VTI1BQ9UEU0 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
VTI1BQ9UEU0 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VTI1BQ9UEU0 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VTI1BQ9UEU0 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
VTI1BQ9UEU0 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
VTI1BQ9UEU0 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
VTI1BQ9UEU0 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
VTI1BQ9UEU0 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VTI1BQ9UEU0 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
VTI1BQ9UEU0 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
VTI1BQ9UEU0 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
VTI1BQ9UEU0 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
VTI1BQ9UEU0 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
VTI1BQ9UEU0 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
VTI1BQ9UEU0 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
VTI1BQ9UEU0 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
VTI1BQ9UEU0 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
VTI1BQ9UEU0 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
VTI1BQ9UEU0 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
VTI1BQ9UEU0 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VTI1BQ9UEU0 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VTI1BQ9UEU0 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VTI1BQ9UEU0 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
VTI1BQ9UEU0 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
VTI1BQ9UEU0 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
VTI1BQ9UEU0 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VTI1BQ9UEU0 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VTI1BQ9UEU0 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
VTI1BQ9UEU0 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
VTI1BQ9UEU0 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VTI1BQ9UEU0 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
VTI1BQ9UEU0 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VTI1BQ9UEU0 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VTI1BQ9UEU0 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
VTI1BQ9UEU0 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VTI1BQ9UEU0 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VTI1BQ9UEU0 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VTI1BQ9UEU0 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VTI1BQ9UEU0 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
VTI1BQ9UEU0 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VTI1BQ9UEU0 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VTI1BQ9UEU0 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VTI1BQ9UEU0 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VTI1BQ9UEU0 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VTI1BQ9UEU0 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VTI1BQ9UEU0 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VTI1BQ9UEU0 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms