Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K6

KLHL42, Kelch-like protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL42Q9P2K6 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLHL42Q9P2K6 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLHL42Q9P2K6 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLHL42Q9P2K6 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
KLHL42Q9P2K6 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
KLHL42Q9P2K6 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLHL42Q9P2K6 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLHL42Q9P2K6 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
KLHL42Q9P2K6 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLHL42Q9P2K6 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLHL42Q9P2K6 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLHL42Q9P2K6 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLHL42Q9P2K6 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLHL42Q9P2K6 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLHL42Q9P2K6 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLHL42Q9P2K6 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLHL42Q9P2K6 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLHL42Q9P2K6 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLHL42Q9P2K6 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
KLHL42Q9P2K6 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLHL42Q9P2K6 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLHL42Q9P2K6 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLHL42Q9P2K6 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
KLHL42Q9P2K6 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
KLHL42Q9P2K6 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
KLHL42Q9P2K6 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
KLHL42Q9P2K6 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
KLHL42Q9P2K6 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
KLHL42Q9P2K6 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
KLHL42Q9P2K6 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
KLHL42Q9P2K6 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
KLHL42Q9P2K6 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
KLHL42Q9P2K6 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
KLHL42Q9P2K6 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KLHL42Q9P2K6 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
KLHL42Q9P2K6 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
KLHL42Q9P2K6 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KLHL42Q9P2K6 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
KLHL42Q9P2K6 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
KLHL42Q9P2K6 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
KLHL42Q9P2K6 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KLHL42Q9P2K6 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
KLHL42Q9P2K6 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KLHL42Q9P2K6 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
KLHL42Q9P2K6 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KLHL42Q9P2K6 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
KLHL42Q9P2K6 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
KLHL42Q9P2K6 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KLHL42Q9P2K6 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL42Q9P2K6 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL42Q9P2K6 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL42Q9P2K6 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL42Q9P2K6 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL42Q9P2K6 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL42Q9P2K6 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL42Q9P2K6 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL42Q9P2K6 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL42Q9P2K6 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL42Q9P2K6 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL42Q9P2K6 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL42Q9P2K6 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL42Q9P2K6 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL42Q9P2K6 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL42Q9P2K6 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL42Q9P2K6 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL42Q9P2K6 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL42Q9P2K6 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL42Q9P2K6 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL42Q9P2K6 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL42Q9P2K6 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL42Q9P2K6 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL42Q9P2K6 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL42Q9P2K6 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL42Q9P2K6 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL42Q9P2K6 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL42Q9P2K6 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL42Q9P2K6 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL42Q9P2K6 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL42Q9P2K6 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL42Q9P2K6 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL42Q9P2K6 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL42Q9P2K6 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL42Q9P2K6 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL42Q9P2K6 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL42Q9P2K6 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL42Q9P2K6 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL42Q9P2K6 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL42Q9P2K6 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL42Q9P2K6 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL42Q9P2K6 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL42Q9P2K6 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL42Q9P2K6 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL42Q9P2K6 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL42Q9P2K6 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL42Q9P2K6 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL42Q9P2K6 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL42Q9P2K6 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL42Q9P2K6 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL42Q9P2K6 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL42Q9P2K6 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms