Protein–RNA interactions for Protein: Q9P267

MBD5, Methyl-CpG-binding domain protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD5Q9P267 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
MBD5Q9P267 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
MBD5Q9P267 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
MBD5Q9P267 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
MBD5Q9P267 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
MBD5Q9P267 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
MBD5Q9P267 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
MBD5Q9P267 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
MBD5Q9P267 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
MBD5Q9P267 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
MBD5Q9P267 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
MBD5Q9P267 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
MBD5Q9P267 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
MBD5Q9P267 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
MBD5Q9P267 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
MBD5Q9P267 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
MBD5Q9P267 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
MBD5Q9P267 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
MBD5Q9P267 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
MBD5Q9P267 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
MBD5Q9P267 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
MBD5Q9P267 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
MBD5Q9P267 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
MBD5Q9P267 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
MBD5Q9P267 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
MBD5Q9P267 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
MBD5Q9P267 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
MBD5Q9P267 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
MBD5Q9P267 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
MBD5Q9P267 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.12■■■□□ 2.09
MBD5Q9P267 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
MBD5Q9P267 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
MBD5Q9P267 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
MBD5Q9P267 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
MBD5Q9P267 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
MBD5Q9P267 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
MBD5Q9P267 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
MBD5Q9P267 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
MBD5Q9P267 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
MBD5Q9P267 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
MBD5Q9P267 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
MBD5Q9P267 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
MBD5Q9P267 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
MBD5Q9P267 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
MBD5Q9P267 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
MBD5Q9P267 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
MBD5Q9P267 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
MBD5Q9P267 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
MBD5Q9P267 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
MBD5Q9P267 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
MBD5Q9P267 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
MBD5Q9P267 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
MBD5Q9P267 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
MBD5Q9P267 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
MBD5Q9P267 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
MBD5Q9P267 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC28.1■■■□□ 2.09
MBD5Q9P267 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
MBD5Q9P267 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
MBD5Q9P267 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
MBD5Q9P267 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
MBD5Q9P267 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
MBD5Q9P267 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC28.1■■■□□ 2.09
MBD5Q9P267 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
MBD5Q9P267 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
MBD5Q9P267 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
MBD5Q9P267 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
MBD5Q9P267 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
MBD5Q9P267 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
MBD5Q9P267 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
MBD5Q9P267 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
MBD5Q9P267 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
MBD5Q9P267 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
MBD5Q9P267 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
MBD5Q9P267 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
MBD5Q9P267 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
MBD5Q9P267 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
MBD5Q9P267 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
MBD5Q9P267 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
MBD5Q9P267 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
MBD5Q9P267 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
MBD5Q9P267 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
MBD5Q9P267 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
MBD5Q9P267 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
MBD5Q9P267 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
MBD5Q9P267 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
MBD5Q9P267 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC28.08■■■□□ 2.09
MBD5Q9P267 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
MBD5Q9P267 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
MBD5Q9P267 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
MBD5Q9P267 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
MBD5Q9P267 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
MBD5Q9P267 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
MBD5Q9P267 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
MBD5Q9P267 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
MBD5Q9P267 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
MBD5Q9P267 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
MBD5Q9P267 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
MBD5Q9P267 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
MBD5Q9P267 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC28.08■■■□□ 2.09
MBD5Q9P267 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms