Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYD6

HOXC10, Homeobox protein Hox-C10, humanhuman

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Length 342 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC10Q9NYD6 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXC10Q9NYD6 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXC10Q9NYD6 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXC10Q9NYD6 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXC10Q9NYD6 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXC10Q9NYD6 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXC10Q9NYD6 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXC10Q9NYD6 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXC10Q9NYD6 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXC10Q9NYD6 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXC10Q9NYD6 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXC10Q9NYD6 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXC10Q9NYD6 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXC10Q9NYD6 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXC10Q9NYD6 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXC10Q9NYD6 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXC10Q9NYD6 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXC10Q9NYD6 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXC10Q9NYD6 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXC10Q9NYD6 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXC10Q9NYD6 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXC10Q9NYD6 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXC10Q9NYD6 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXC10Q9NYD6 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXC10Q9NYD6 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXC10Q9NYD6 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXC10Q9NYD6 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXC10Q9NYD6 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXC10Q9NYD6 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXC10Q9NYD6 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXC10Q9NYD6 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXC10Q9NYD6 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXC10Q9NYD6 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXC10Q9NYD6 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXC10Q9NYD6 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXC10Q9NYD6 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXC10Q9NYD6 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXC10Q9NYD6 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXC10Q9NYD6 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXC10Q9NYD6 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXC10Q9NYD6 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXC10Q9NYD6 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXC10Q9NYD6 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXC10Q9NYD6 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXC10Q9NYD6 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXC10Q9NYD6 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXC10Q9NYD6 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXC10Q9NYD6 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXC10Q9NYD6 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXC10Q9NYD6 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXC10Q9NYD6 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXC10Q9NYD6 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXC10Q9NYD6 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXC10Q9NYD6 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXC10Q9NYD6 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXC10Q9NYD6 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXC10Q9NYD6 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXC10Q9NYD6 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXC10Q9NYD6 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXC10Q9NYD6 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXC10Q9NYD6 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXC10Q9NYD6 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXC10Q9NYD6 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXC10Q9NYD6 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXC10Q9NYD6 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXC10Q9NYD6 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXC10Q9NYD6 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXC10Q9NYD6 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXC10Q9NYD6 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXC10Q9NYD6 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXC10Q9NYD6 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXC10Q9NYD6 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXC10Q9NYD6 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXC10Q9NYD6 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXC10Q9NYD6 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXC10Q9NYD6 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXC10Q9NYD6 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXC10Q9NYD6 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXC10Q9NYD6 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXC10Q9NYD6 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXC10Q9NYD6 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXC10Q9NYD6 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXC10Q9NYD6 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXC10Q9NYD6 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXC10Q9NYD6 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXC10Q9NYD6 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXC10Q9NYD6 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXC10Q9NYD6 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXC10Q9NYD6 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXC10Q9NYD6 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXC10Q9NYD6 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXC10Q9NYD6 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXC10Q9NYD6 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXC10Q9NYD6 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXC10Q9NYD6 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXC10Q9NYD6 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXC10Q9NYD6 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXC10Q9NYD6 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXC10Q9NYD6 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXC10Q9NYD6 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
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