Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXH9

TRMT1, tRNA (guanine(26)-N(2))-dimethyltransferase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMT1Q9NXH9 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRMT1Q9NXH9 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRMT1Q9NXH9 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRMT1Q9NXH9 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRMT1Q9NXH9 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRMT1Q9NXH9 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRMT1Q9NXH9 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRMT1Q9NXH9 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRMT1Q9NXH9 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRMT1Q9NXH9 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRMT1Q9NXH9 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRMT1Q9NXH9 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRMT1Q9NXH9 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRMT1Q9NXH9 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRMT1Q9NXH9 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRMT1Q9NXH9 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRMT1Q9NXH9 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRMT1Q9NXH9 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRMT1Q9NXH9 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRMT1Q9NXH9 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRMT1Q9NXH9 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRMT1Q9NXH9 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRMT1Q9NXH9 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRMT1Q9NXH9 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRMT1Q9NXH9 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
TRMT1Q9NXH9 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRMT1Q9NXH9 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRMT1Q9NXH9 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRMT1Q9NXH9 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRMT1Q9NXH9 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRMT1Q9NXH9 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRMT1Q9NXH9 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRMT1Q9NXH9 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRMT1Q9NXH9 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRMT1Q9NXH9 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRMT1Q9NXH9 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRMT1Q9NXH9 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRMT1Q9NXH9 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRMT1Q9NXH9 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRMT1Q9NXH9 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRMT1Q9NXH9 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRMT1Q9NXH9 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRMT1Q9NXH9 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRMT1Q9NXH9 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRMT1Q9NXH9 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRMT1Q9NXH9 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRMT1Q9NXH9 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRMT1Q9NXH9 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRMT1Q9NXH9 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
TRMT1Q9NXH9 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRMT1Q9NXH9 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
TRMT1Q9NXH9 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRMT1Q9NXH9 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRMT1Q9NXH9 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRMT1Q9NXH9 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRMT1Q9NXH9 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRMT1Q9NXH9 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRMT1Q9NXH9 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRMT1Q9NXH9 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRMT1Q9NXH9 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRMT1Q9NXH9 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRMT1Q9NXH9 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRMT1Q9NXH9 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRMT1Q9NXH9 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRMT1Q9NXH9 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRMT1Q9NXH9 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRMT1Q9NXH9 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRMT1Q9NXH9 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRMT1Q9NXH9 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRMT1Q9NXH9 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRMT1Q9NXH9 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRMT1Q9NXH9 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRMT1Q9NXH9 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRMT1Q9NXH9 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRMT1Q9NXH9 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRMT1Q9NXH9 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRMT1Q9NXH9 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRMT1Q9NXH9 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRMT1Q9NXH9 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRMT1Q9NXH9 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRMT1Q9NXH9 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRMT1Q9NXH9 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRMT1Q9NXH9 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRMT1Q9NXH9 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRMT1Q9NXH9 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRMT1Q9NXH9 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRMT1Q9NXH9 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRMT1Q9NXH9 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRMT1Q9NXH9 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRMT1Q9NXH9 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRMT1Q9NXH9 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRMT1Q9NXH9 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRMT1Q9NXH9 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRMT1Q9NXH9 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRMT1Q9NXH9 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRMT1Q9NXH9 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRMT1Q9NXH9 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRMT1Q9NXH9 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRMT1Q9NXH9 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRMT1Q9NXH9 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms