Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVP2

ASF1B, Histone chaperone ASF1B, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASF1BQ9NVP2 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ASF1BQ9NVP2 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ASF1BQ9NVP2 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ASF1BQ9NVP2 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ASF1BQ9NVP2 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ASF1BQ9NVP2 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ASF1BQ9NVP2 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ASF1BQ9NVP2 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ASF1BQ9NVP2 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ASF1BQ9NVP2 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ASF1BQ9NVP2 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ASF1BQ9NVP2 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ASF1BQ9NVP2 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ASF1BQ9NVP2 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ASF1BQ9NVP2 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ASF1BQ9NVP2 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ASF1BQ9NVP2 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ASF1BQ9NVP2 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ASF1BQ9NVP2 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ASF1BQ9NVP2 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ASF1BQ9NVP2 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ASF1BQ9NVP2 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ASF1BQ9NVP2 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ASF1BQ9NVP2 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ASF1BQ9NVP2 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ASF1BQ9NVP2 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ASF1BQ9NVP2 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ASF1BQ9NVP2 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ASF1BQ9NVP2 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ASF1BQ9NVP2 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ASF1BQ9NVP2 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ASF1BQ9NVP2 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
ASF1BQ9NVP2 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ASF1BQ9NVP2 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ASF1BQ9NVP2 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
ASF1BQ9NVP2 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ASF1BQ9NVP2 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ASF1BQ9NVP2 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ASF1BQ9NVP2 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ASF1BQ9NVP2 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ASF1BQ9NVP2 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ASF1BQ9NVP2 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ASF1BQ9NVP2 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ASF1BQ9NVP2 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ASF1BQ9NVP2 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ASF1BQ9NVP2 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ASF1BQ9NVP2 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ASF1BQ9NVP2 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ASF1BQ9NVP2 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ASF1BQ9NVP2 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ASF1BQ9NVP2 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ASF1BQ9NVP2 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ASF1BQ9NVP2 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ASF1BQ9NVP2 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ASF1BQ9NVP2 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ASF1BQ9NVP2 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ASF1BQ9NVP2 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ASF1BQ9NVP2 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ASF1BQ9NVP2 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ASF1BQ9NVP2 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
ASF1BQ9NVP2 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ASF1BQ9NVP2 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ASF1BQ9NVP2 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ASF1BQ9NVP2 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
ASF1BQ9NVP2 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ASF1BQ9NVP2 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ASF1BQ9NVP2 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
ASF1BQ9NVP2 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
ASF1BQ9NVP2 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ASF1BQ9NVP2 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ASF1BQ9NVP2 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
ASF1BQ9NVP2 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ASF1BQ9NVP2 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ASF1BQ9NVP2 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ASF1BQ9NVP2 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ASF1BQ9NVP2 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ASF1BQ9NVP2 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ASF1BQ9NVP2 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ASF1BQ9NVP2 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ASF1BQ9NVP2 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ASF1BQ9NVP2 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ASF1BQ9NVP2 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ASF1BQ9NVP2 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ASF1BQ9NVP2 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ASF1BQ9NVP2 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ASF1BQ9NVP2 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ASF1BQ9NVP2 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ASF1BQ9NVP2 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ASF1BQ9NVP2 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ASF1BQ9NVP2 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ASF1BQ9NVP2 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ASF1BQ9NVP2 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ASF1BQ9NVP2 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ASF1BQ9NVP2 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ASF1BQ9NVP2 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ASF1BQ9NVP2 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ASF1BQ9NVP2 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ASF1BQ9NVP2 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ASF1BQ9NVP2 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ASF1BQ9NVP2 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms