Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVI7

ATAD3A, ATPase family AAA domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD3AQ9NVI7 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATAD3AQ9NVI7 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATAD3AQ9NVI7 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATAD3AQ9NVI7 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATAD3AQ9NVI7 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATAD3AQ9NVI7 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATAD3AQ9NVI7 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATAD3AQ9NVI7 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATAD3AQ9NVI7 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATAD3AQ9NVI7 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATAD3AQ9NVI7 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATAD3AQ9NVI7 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATAD3AQ9NVI7 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATAD3AQ9NVI7 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATAD3AQ9NVI7 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATAD3AQ9NVI7 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATAD3AQ9NVI7 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ATAD3AQ9NVI7 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATAD3AQ9NVI7 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATAD3AQ9NVI7 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATAD3AQ9NVI7 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATAD3AQ9NVI7 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATAD3AQ9NVI7 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATAD3AQ9NVI7 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATAD3AQ9NVI7 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATAD3AQ9NVI7 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATAD3AQ9NVI7 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATAD3AQ9NVI7 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATAD3AQ9NVI7 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATAD3AQ9NVI7 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATAD3AQ9NVI7 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATAD3AQ9NVI7 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATAD3AQ9NVI7 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATAD3AQ9NVI7 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ATAD3AQ9NVI7 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ATAD3AQ9NVI7 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATAD3AQ9NVI7 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATAD3AQ9NVI7 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ATAD3AQ9NVI7 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATAD3AQ9NVI7 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATAD3AQ9NVI7 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATAD3AQ9NVI7 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ATAD3AQ9NVI7 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATAD3AQ9NVI7 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATAD3AQ9NVI7 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATAD3AQ9NVI7 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATAD3AQ9NVI7 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ATAD3AQ9NVI7 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ATAD3AQ9NVI7 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ATAD3AQ9NVI7 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
ATAD3AQ9NVI7 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATAD3AQ9NVI7 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ATAD3AQ9NVI7 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATAD3AQ9NVI7 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATAD3AQ9NVI7 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATAD3AQ9NVI7 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATAD3AQ9NVI7 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATAD3AQ9NVI7 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ATAD3AQ9NVI7 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ATAD3AQ9NVI7 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ATAD3AQ9NVI7 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ATAD3AQ9NVI7 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ATAD3AQ9NVI7 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATAD3AQ9NVI7 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ATAD3AQ9NVI7 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ATAD3AQ9NVI7 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATAD3AQ9NVI7 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATAD3AQ9NVI7 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATAD3AQ9NVI7 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATAD3AQ9NVI7 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATAD3AQ9NVI7 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATAD3AQ9NVI7 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATAD3AQ9NVI7 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ATAD3AQ9NVI7 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATAD3AQ9NVI7 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATAD3AQ9NVI7 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATAD3AQ9NVI7 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATAD3AQ9NVI7 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATAD3AQ9NVI7 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATAD3AQ9NVI7 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATAD3AQ9NVI7 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATAD3AQ9NVI7 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATAD3AQ9NVI7 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATAD3AQ9NVI7 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATAD3AQ9NVI7 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATAD3AQ9NVI7 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATAD3AQ9NVI7 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATAD3AQ9NVI7 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATAD3AQ9NVI7 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATAD3AQ9NVI7 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATAD3AQ9NVI7 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATAD3AQ9NVI7 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATAD3AQ9NVI7 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATAD3AQ9NVI7 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATAD3AQ9NVI7 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATAD3AQ9NVI7 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATAD3AQ9NVI7 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATAD3AQ9NVI7 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATAD3AQ9NVI7 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATAD3AQ9NVI7 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms