Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSD5

SLC6A13, Sodium- and chloride-dependent GABA transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A13Q9NSD5 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC6A13Q9NSD5 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC6A13Q9NSD5 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC6A13Q9NSD5 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC6A13Q9NSD5 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC6A13Q9NSD5 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC6A13Q9NSD5 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC6A13Q9NSD5 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC6A13Q9NSD5 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC6A13Q9NSD5 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC6A13Q9NSD5 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC6A13Q9NSD5 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC6A13Q9NSD5 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC6A13Q9NSD5 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC6A13Q9NSD5 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC6A13Q9NSD5 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC6A13Q9NSD5 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC6A13Q9NSD5 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC6A13Q9NSD5 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC6A13Q9NSD5 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC6A13Q9NSD5 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC6A13Q9NSD5 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC6A13Q9NSD5 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC6A13Q9NSD5 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC6A13Q9NSD5 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC6A13Q9NSD5 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC6A13Q9NSD5 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC6A13Q9NSD5 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC6A13Q9NSD5 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLC6A13Q9NSD5 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLC6A13Q9NSD5 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLC6A13Q9NSD5 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLC6A13Q9NSD5 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLC6A13Q9NSD5 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLC6A13Q9NSD5 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLC6A13Q9NSD5 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLC6A13Q9NSD5 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SLC6A13Q9NSD5 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SLC6A13Q9NSD5 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLC6A13Q9NSD5 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLC6A13Q9NSD5 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SLC6A13Q9NSD5 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SLC6A13Q9NSD5 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SLC6A13Q9NSD5 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLC6A13Q9NSD5 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLC6A13Q9NSD5 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLC6A13Q9NSD5 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLC6A13Q9NSD5 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLC6A13Q9NSD5 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLC6A13Q9NSD5 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLC6A13Q9NSD5 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
SLC6A13Q9NSD5 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
SLC6A13Q9NSD5 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC6A13Q9NSD5 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC6A13Q9NSD5 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC6A13Q9NSD5 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC6A13Q9NSD5 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC6A13Q9NSD5 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC6A13Q9NSD5 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC6A13Q9NSD5 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC6A13Q9NSD5 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC6A13Q9NSD5 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC6A13Q9NSD5 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC6A13Q9NSD5 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC6A13Q9NSD5 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC6A13Q9NSD5 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC6A13Q9NSD5 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC6A13Q9NSD5 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC6A13Q9NSD5 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC6A13Q9NSD5 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC6A13Q9NSD5 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC6A13Q9NSD5 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC6A13Q9NSD5 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC6A13Q9NSD5 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC6A13Q9NSD5 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC6A13Q9NSD5 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC6A13Q9NSD5 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC6A13Q9NSD5 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC6A13Q9NSD5 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC6A13Q9NSD5 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC6A13Q9NSD5 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC6A13Q9NSD5 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC6A13Q9NSD5 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC6A13Q9NSD5 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC6A13Q9NSD5 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC6A13Q9NSD5 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC6A13Q9NSD5 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC6A13Q9NSD5 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC6A13Q9NSD5 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC6A13Q9NSD5 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC6A13Q9NSD5 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC6A13Q9NSD5 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC6A13Q9NSD5 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC6A13Q9NSD5 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC6A13Q9NSD5 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC6A13Q9NSD5 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC6A13Q9NSD5 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC6A13Q9NSD5 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC6A13Q9NSD5 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC6A13Q9NSD5 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms