Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQX3

GPHN, Gephyrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPHNQ9NQX3 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GPHNQ9NQX3 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GPHNQ9NQX3 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GPHNQ9NQX3 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GPHNQ9NQX3 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GPHNQ9NQX3 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GPHNQ9NQX3 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GPHNQ9NQX3 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GPHNQ9NQX3 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GPHNQ9NQX3 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GPHNQ9NQX3 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GPHNQ9NQX3 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GPHNQ9NQX3 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GPHNQ9NQX3 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GPHNQ9NQX3 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GPHNQ9NQX3 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
GPHNQ9NQX3 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GPHNQ9NQX3 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GPHNQ9NQX3 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GPHNQ9NQX3 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GPHNQ9NQX3 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GPHNQ9NQX3 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GPHNQ9NQX3 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GPHNQ9NQX3 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GPHNQ9NQX3 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GPHNQ9NQX3 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
GPHNQ9NQX3 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GPHNQ9NQX3 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GPHNQ9NQX3 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GPHNQ9NQX3 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GPHNQ9NQX3 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GPHNQ9NQX3 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GPHNQ9NQX3 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GPHNQ9NQX3 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GPHNQ9NQX3 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GPHNQ9NQX3 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
GPHNQ9NQX3 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GPHNQ9NQX3 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GPHNQ9NQX3 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GPHNQ9NQX3 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GPHNQ9NQX3 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GPHNQ9NQX3 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GPHNQ9NQX3 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
GPHNQ9NQX3 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GPHNQ9NQX3 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GPHNQ9NQX3 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
GPHNQ9NQX3 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
GPHNQ9NQX3 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GPHNQ9NQX3 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GPHNQ9NQX3 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GPHNQ9NQX3 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GPHNQ9NQX3 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GPHNQ9NQX3 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GPHNQ9NQX3 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GPHNQ9NQX3 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GPHNQ9NQX3 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GPHNQ9NQX3 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GPHNQ9NQX3 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GPHNQ9NQX3 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GPHNQ9NQX3 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GPHNQ9NQX3 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
GPHNQ9NQX3 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
GPHNQ9NQX3 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GPHNQ9NQX3 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
GPHNQ9NQX3 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GPHNQ9NQX3 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GPHNQ9NQX3 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GPHNQ9NQX3 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GPHNQ9NQX3 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
GPHNQ9NQX3 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GPHNQ9NQX3 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GPHNQ9NQX3 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GPHNQ9NQX3 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GPHNQ9NQX3 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GPHNQ9NQX3 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GPHNQ9NQX3 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GPHNQ9NQX3 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GPHNQ9NQX3 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GPHNQ9NQX3 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GPHNQ9NQX3 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GPHNQ9NQX3 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
GPHNQ9NQX3 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GPHNQ9NQX3 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GPHNQ9NQX3 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GPHNQ9NQX3 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GPHNQ9NQX3 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GPHNQ9NQX3 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GPHNQ9NQX3 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GPHNQ9NQX3 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GPHNQ9NQX3 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GPHNQ9NQX3 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GPHNQ9NQX3 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GPHNQ9NQX3 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GPHNQ9NQX3 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GPHNQ9NQX3 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GPHNQ9NQX3 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GPHNQ9NQX3 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GPHNQ9NQX3 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GPHNQ9NQX3 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GPHNQ9NQX3 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms