Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQS7

INCENP, Inner centromere protein, humanhuman

Predictions only

Length 918 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INCENPQ9NQS7 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
INCENPQ9NQS7 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
INCENPQ9NQS7 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
INCENPQ9NQS7 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
INCENPQ9NQS7 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
INCENPQ9NQS7 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
INCENPQ9NQS7 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
INCENPQ9NQS7 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
INCENPQ9NQS7 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
INCENPQ9NQS7 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
INCENPQ9NQS7 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
INCENPQ9NQS7 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
INCENPQ9NQS7 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
INCENPQ9NQS7 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
INCENPQ9NQS7 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
INCENPQ9NQS7 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
INCENPQ9NQS7 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
INCENPQ9NQS7 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
INCENPQ9NQS7 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
INCENPQ9NQS7 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
INCENPQ9NQS7 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
INCENPQ9NQS7 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
INCENPQ9NQS7 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
INCENPQ9NQS7 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
INCENPQ9NQS7 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
INCENPQ9NQS7 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
INCENPQ9NQS7 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
INCENPQ9NQS7 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
INCENPQ9NQS7 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
INCENPQ9NQS7 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
INCENPQ9NQS7 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
INCENPQ9NQS7 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
INCENPQ9NQS7 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
INCENPQ9NQS7 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
INCENPQ9NQS7 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
INCENPQ9NQS7 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
INCENPQ9NQS7 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
INCENPQ9NQS7 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
INCENPQ9NQS7 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
INCENPQ9NQS7 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
INCENPQ9NQS7 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
INCENPQ9NQS7 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
INCENPQ9NQS7 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
INCENPQ9NQS7 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
INCENPQ9NQS7 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
INCENPQ9NQS7 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
INCENPQ9NQS7 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
INCENPQ9NQS7 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
INCENPQ9NQS7 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
INCENPQ9NQS7 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
INCENPQ9NQS7 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
INCENPQ9NQS7 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
INCENPQ9NQS7 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
INCENPQ9NQS7 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
INCENPQ9NQS7 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
INCENPQ9NQS7 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
INCENPQ9NQS7 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
INCENPQ9NQS7 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
INCENPQ9NQS7 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
INCENPQ9NQS7 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
INCENPQ9NQS7 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
INCENPQ9NQS7 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
INCENPQ9NQS7 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
INCENPQ9NQS7 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
INCENPQ9NQS7 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
INCENPQ9NQS7 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
INCENPQ9NQS7 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
INCENPQ9NQS7 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
INCENPQ9NQS7 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
INCENPQ9NQS7 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
INCENPQ9NQS7 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
INCENPQ9NQS7 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
INCENPQ9NQS7 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
INCENPQ9NQS7 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
INCENPQ9NQS7 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
INCENPQ9NQS7 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
INCENPQ9NQS7 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
INCENPQ9NQS7 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
INCENPQ9NQS7 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
INCENPQ9NQS7 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
INCENPQ9NQS7 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
INCENPQ9NQS7 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
INCENPQ9NQS7 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
INCENPQ9NQS7 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
INCENPQ9NQS7 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
INCENPQ9NQS7 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
INCENPQ9NQS7 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
INCENPQ9NQS7 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
INCENPQ9NQS7 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
INCENPQ9NQS7 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
INCENPQ9NQS7 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
INCENPQ9NQS7 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
INCENPQ9NQS7 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
INCENPQ9NQS7 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
INCENPQ9NQS7 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
INCENPQ9NQS7 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
INCENPQ9NQS7 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
INCENPQ9NQS7 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
INCENPQ9NQS7 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
INCENPQ9NQS7 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms