Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ76

MEPE, Matrix extracellular phosphoglycoprotein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEPEQ9NQ76 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MEPEQ9NQ76 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MEPEQ9NQ76 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MEPEQ9NQ76 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MEPEQ9NQ76 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MEPEQ9NQ76 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MEPEQ9NQ76 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MEPEQ9NQ76 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MEPEQ9NQ76 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MEPEQ9NQ76 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MEPEQ9NQ76 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MEPEQ9NQ76 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MEPEQ9NQ76 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
MEPEQ9NQ76 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MEPEQ9NQ76 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MEPEQ9NQ76 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MEPEQ9NQ76 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MEPEQ9NQ76 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MEPEQ9NQ76 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MEPEQ9NQ76 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MEPEQ9NQ76 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MEPEQ9NQ76 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MEPEQ9NQ76 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MEPEQ9NQ76 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MEPEQ9NQ76 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MEPEQ9NQ76 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MEPEQ9NQ76 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MEPEQ9NQ76 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MEPEQ9NQ76 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MEPEQ9NQ76 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
MEPEQ9NQ76 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MEPEQ9NQ76 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MEPEQ9NQ76 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MEPEQ9NQ76 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
MEPEQ9NQ76 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MEPEQ9NQ76 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
MEPEQ9NQ76 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MEPEQ9NQ76 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MEPEQ9NQ76 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MEPEQ9NQ76 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MEPEQ9NQ76 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MEPEQ9NQ76 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MEPEQ9NQ76 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MEPEQ9NQ76 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MEPEQ9NQ76 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MEPEQ9NQ76 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MEPEQ9NQ76 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MEPEQ9NQ76 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MEPEQ9NQ76 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MEPEQ9NQ76 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MEPEQ9NQ76 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MEPEQ9NQ76 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MEPEQ9NQ76 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
MEPEQ9NQ76 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MEPEQ9NQ76 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MEPEQ9NQ76 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MEPEQ9NQ76 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MEPEQ9NQ76 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MEPEQ9NQ76 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MEPEQ9NQ76 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MEPEQ9NQ76 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MEPEQ9NQ76 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MEPEQ9NQ76 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MEPEQ9NQ76 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MEPEQ9NQ76 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MEPEQ9NQ76 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MEPEQ9NQ76 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MEPEQ9NQ76 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
MEPEQ9NQ76 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MEPEQ9NQ76 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MEPEQ9NQ76 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MEPEQ9NQ76 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
MEPEQ9NQ76 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MEPEQ9NQ76 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MEPEQ9NQ76 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MEPEQ9NQ76 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MEPEQ9NQ76 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MEPEQ9NQ76 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MEPEQ9NQ76 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MEPEQ9NQ76 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MEPEQ9NQ76 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MEPEQ9NQ76 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MEPEQ9NQ76 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
MEPEQ9NQ76 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
MEPEQ9NQ76 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MEPEQ9NQ76 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MEPEQ9NQ76 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MEPEQ9NQ76 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MEPEQ9NQ76 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
MEPEQ9NQ76 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MEPEQ9NQ76 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MEPEQ9NQ76 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MEPEQ9NQ76 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MEPEQ9NQ76 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MEPEQ9NQ76 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MEPEQ9NQ76 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
MEPEQ9NQ76 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
MEPEQ9NQ76 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MEPEQ9NQ76 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MEPEQ9NQ76 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms