Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPC4

A4GALT, Lactosylceramide 4-alpha-galactosyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A4GALTQ9NPC4 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
A4GALTQ9NPC4 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
A4GALTQ9NPC4 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
A4GALTQ9NPC4 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
A4GALTQ9NPC4 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
A4GALTQ9NPC4 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
A4GALTQ9NPC4 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
A4GALTQ9NPC4 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
A4GALTQ9NPC4 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
A4GALTQ9NPC4 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
A4GALTQ9NPC4 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
A4GALTQ9NPC4 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
A4GALTQ9NPC4 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
A4GALTQ9NPC4 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
A4GALTQ9NPC4 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
A4GALTQ9NPC4 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
A4GALTQ9NPC4 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
A4GALTQ9NPC4 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
A4GALTQ9NPC4 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
A4GALTQ9NPC4 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
A4GALTQ9NPC4 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
A4GALTQ9NPC4 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
A4GALTQ9NPC4 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
A4GALTQ9NPC4 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
A4GALTQ9NPC4 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
A4GALTQ9NPC4 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
A4GALTQ9NPC4 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
A4GALTQ9NPC4 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
A4GALTQ9NPC4 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
A4GALTQ9NPC4 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
A4GALTQ9NPC4 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
A4GALTQ9NPC4 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
A4GALTQ9NPC4 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
A4GALTQ9NPC4 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
A4GALTQ9NPC4 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
A4GALTQ9NPC4 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
A4GALTQ9NPC4 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
A4GALTQ9NPC4 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
A4GALTQ9NPC4 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
A4GALTQ9NPC4 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
A4GALTQ9NPC4 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
A4GALTQ9NPC4 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
A4GALTQ9NPC4 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
A4GALTQ9NPC4 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
A4GALTQ9NPC4 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
A4GALTQ9NPC4 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
A4GALTQ9NPC4 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
A4GALTQ9NPC4 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
A4GALTQ9NPC4 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
A4GALTQ9NPC4 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
A4GALTQ9NPC4 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
A4GALTQ9NPC4 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
A4GALTQ9NPC4 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
A4GALTQ9NPC4 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
A4GALTQ9NPC4 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
A4GALTQ9NPC4 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
A4GALTQ9NPC4 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
A4GALTQ9NPC4 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
A4GALTQ9NPC4 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
A4GALTQ9NPC4 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
A4GALTQ9NPC4 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
A4GALTQ9NPC4 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
A4GALTQ9NPC4 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
A4GALTQ9NPC4 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
A4GALTQ9NPC4 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
A4GALTQ9NPC4 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
A4GALTQ9NPC4 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
A4GALTQ9NPC4 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
A4GALTQ9NPC4 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
A4GALTQ9NPC4 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
A4GALTQ9NPC4 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
A4GALTQ9NPC4 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
A4GALTQ9NPC4 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
A4GALTQ9NPC4 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
A4GALTQ9NPC4 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
A4GALTQ9NPC4 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
A4GALTQ9NPC4 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
A4GALTQ9NPC4 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
A4GALTQ9NPC4 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
A4GALTQ9NPC4 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
A4GALTQ9NPC4 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
A4GALTQ9NPC4 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
A4GALTQ9NPC4 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
A4GALTQ9NPC4 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
A4GALTQ9NPC4 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
A4GALTQ9NPC4 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
A4GALTQ9NPC4 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
A4GALTQ9NPC4 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
A4GALTQ9NPC4 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
A4GALTQ9NPC4 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
A4GALTQ9NPC4 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
A4GALTQ9NPC4 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
A4GALTQ9NPC4 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
A4GALTQ9NPC4 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
A4GALTQ9NPC4 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
A4GALTQ9NPC4 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
A4GALTQ9NPC4 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
A4GALTQ9NPC4 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
A4GALTQ9NPC4 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
A4GALTQ9NPC4 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms