Protein–RNA interactions for Protein: Q9HB65

ELL3, RNA polymerase II elongation factor ELL3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELL3Q9HB65 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ELL3Q9HB65 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ELL3Q9HB65 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ELL3Q9HB65 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ELL3Q9HB65 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ELL3Q9HB65 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ELL3Q9HB65 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ELL3Q9HB65 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ELL3Q9HB65 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ELL3Q9HB65 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ELL3Q9HB65 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ELL3Q9HB65 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ELL3Q9HB65 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ELL3Q9HB65 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ELL3Q9HB65 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ELL3Q9HB65 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ELL3Q9HB65 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ELL3Q9HB65 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ELL3Q9HB65 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ELL3Q9HB65 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ELL3Q9HB65 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ELL3Q9HB65 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ELL3Q9HB65 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ELL3Q9HB65 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ELL3Q9HB65 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ELL3Q9HB65 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ELL3Q9HB65 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ELL3Q9HB65 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ELL3Q9HB65 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ELL3Q9HB65 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ELL3Q9HB65 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ELL3Q9HB65 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ELL3Q9HB65 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ELL3Q9HB65 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ELL3Q9HB65 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ELL3Q9HB65 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ELL3Q9HB65 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ELL3Q9HB65 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ELL3Q9HB65 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ELL3Q9HB65 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ELL3Q9HB65 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ELL3Q9HB65 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ELL3Q9HB65 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ELL3Q9HB65 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ELL3Q9HB65 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ELL3Q9HB65 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ELL3Q9HB65 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ELL3Q9HB65 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ELL3Q9HB65 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ELL3Q9HB65 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ELL3Q9HB65 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ELL3Q9HB65 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ELL3Q9HB65 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ELL3Q9HB65 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ELL3Q9HB65 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ELL3Q9HB65 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ELL3Q9HB65 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ELL3Q9HB65 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ELL3Q9HB65 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ELL3Q9HB65 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ELL3Q9HB65 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ELL3Q9HB65 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ELL3Q9HB65 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ELL3Q9HB65 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ELL3Q9HB65 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ELL3Q9HB65 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ELL3Q9HB65 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ELL3Q9HB65 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ELL3Q9HB65 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ELL3Q9HB65 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ELL3Q9HB65 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ELL3Q9HB65 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ELL3Q9HB65 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ELL3Q9HB65 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ELL3Q9HB65 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ELL3Q9HB65 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ELL3Q9HB65 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ELL3Q9HB65 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ELL3Q9HB65 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ELL3Q9HB65 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ELL3Q9HB65 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ELL3Q9HB65 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ELL3Q9HB65 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ELL3Q9HB65 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ELL3Q9HB65 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ELL3Q9HB65 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ELL3Q9HB65 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ELL3Q9HB65 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ELL3Q9HB65 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ELL3Q9HB65 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ELL3Q9HB65 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ELL3Q9HB65 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ELL3Q9HB65 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ELL3Q9HB65 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ELL3Q9HB65 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ELL3Q9HB65 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ELL3Q9HB65 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ELL3Q9HB65 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ELL3Q9HB65 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ELL3Q9HB65 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms