Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7Z3

NRDE2, Protein NRDE2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRDE2Q9H7Z3 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NRDE2Q9H7Z3 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NRDE2Q9H7Z3 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NRDE2Q9H7Z3 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NRDE2Q9H7Z3 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NRDE2Q9H7Z3 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NRDE2Q9H7Z3 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NRDE2Q9H7Z3 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NRDE2Q9H7Z3 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NRDE2Q9H7Z3 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NRDE2Q9H7Z3 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NRDE2Q9H7Z3 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NRDE2Q9H7Z3 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NRDE2Q9H7Z3 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NRDE2Q9H7Z3 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NRDE2Q9H7Z3 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NRDE2Q9H7Z3 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NRDE2Q9H7Z3 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NRDE2Q9H7Z3 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NRDE2Q9H7Z3 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NRDE2Q9H7Z3 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NRDE2Q9H7Z3 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NRDE2Q9H7Z3 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NRDE2Q9H7Z3 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NRDE2Q9H7Z3 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NRDE2Q9H7Z3 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NRDE2Q9H7Z3 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NRDE2Q9H7Z3 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NRDE2Q9H7Z3 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NRDE2Q9H7Z3 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NRDE2Q9H7Z3 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NRDE2Q9H7Z3 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NRDE2Q9H7Z3 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NRDE2Q9H7Z3 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
NRDE2Q9H7Z3 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NRDE2Q9H7Z3 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NRDE2Q9H7Z3 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NRDE2Q9H7Z3 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NRDE2Q9H7Z3 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NRDE2Q9H7Z3 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NRDE2Q9H7Z3 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NRDE2Q9H7Z3 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NRDE2Q9H7Z3 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NRDE2Q9H7Z3 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NRDE2Q9H7Z3 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NRDE2Q9H7Z3 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NRDE2Q9H7Z3 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NRDE2Q9H7Z3 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NRDE2Q9H7Z3 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NRDE2Q9H7Z3 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NRDE2Q9H7Z3 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NRDE2Q9H7Z3 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NRDE2Q9H7Z3 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NRDE2Q9H7Z3 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NRDE2Q9H7Z3 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NRDE2Q9H7Z3 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NRDE2Q9H7Z3 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
NRDE2Q9H7Z3 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
NRDE2Q9H7Z3 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
NRDE2Q9H7Z3 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NRDE2Q9H7Z3 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NRDE2Q9H7Z3 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NRDE2Q9H7Z3 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NRDE2Q9H7Z3 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NRDE2Q9H7Z3 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NRDE2Q9H7Z3 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NRDE2Q9H7Z3 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NRDE2Q9H7Z3 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
NRDE2Q9H7Z3 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NRDE2Q9H7Z3 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NRDE2Q9H7Z3 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NRDE2Q9H7Z3 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NRDE2Q9H7Z3 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NRDE2Q9H7Z3 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NRDE2Q9H7Z3 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NRDE2Q9H7Z3 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
NRDE2Q9H7Z3 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NRDE2Q9H7Z3 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NRDE2Q9H7Z3 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NRDE2Q9H7Z3 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NRDE2Q9H7Z3 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NRDE2Q9H7Z3 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NRDE2Q9H7Z3 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NRDE2Q9H7Z3 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NRDE2Q9H7Z3 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NRDE2Q9H7Z3 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NRDE2Q9H7Z3 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NRDE2Q9H7Z3 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NRDE2Q9H7Z3 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
NRDE2Q9H7Z3 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NRDE2Q9H7Z3 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NRDE2Q9H7Z3 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NRDE2Q9H7Z3 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NRDE2Q9H7Z3 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NRDE2Q9H7Z3 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NRDE2Q9H7Z3 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NRDE2Q9H7Z3 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NRDE2Q9H7Z3 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NRDE2Q9H7Z3 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NRDE2Q9H7Z3 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms