Protein–RNA interactions for Protein: Q9C075

KRT23, Keratin, type I cytoskeletal 23, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT23Q9C075 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRT23Q9C075 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRT23Q9C075 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
KRT23Q9C075 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRT23Q9C075 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRT23Q9C075 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRT23Q9C075 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRT23Q9C075 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRT23Q9C075 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRT23Q9C075 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT23Q9C075 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT23Q9C075 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT23Q9C075 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT23Q9C075 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT23Q9C075 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT23Q9C075 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT23Q9C075 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT23Q9C075 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT23Q9C075 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT23Q9C075 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT23Q9C075 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT23Q9C075 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT23Q9C075 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT23Q9C075 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT23Q9C075 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT23Q9C075 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT23Q9C075 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT23Q9C075 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KRT23Q9C075 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KRT23Q9C075 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KRT23Q9C075 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KRT23Q9C075 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KRT23Q9C075 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KRT23Q9C075 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KRT23Q9C075 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
KRT23Q9C075 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KRT23Q9C075 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KRT23Q9C075 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KRT23Q9C075 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KRT23Q9C075 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KRT23Q9C075 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KRT23Q9C075 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KRT23Q9C075 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
KRT23Q9C075 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
KRT23Q9C075 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KRT23Q9C075 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KRT23Q9C075 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KRT23Q9C075 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
KRT23Q9C075 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
KRT23Q9C075 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
KRT23Q9C075 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
KRT23Q9C075 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
KRT23Q9C075 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
KRT23Q9C075 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
KRT23Q9C075 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
KRT23Q9C075 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
KRT23Q9C075 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
KRT23Q9C075 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT23Q9C075 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT23Q9C075 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT23Q9C075 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT23Q9C075 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT23Q9C075 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT23Q9C075 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT23Q9C075 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT23Q9C075 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT23Q9C075 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT23Q9C075 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT23Q9C075 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT23Q9C075 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT23Q9C075 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT23Q9C075 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT23Q9C075 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT23Q9C075 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT23Q9C075 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT23Q9C075 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT23Q9C075 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT23Q9C075 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT23Q9C075 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT23Q9C075 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT23Q9C075 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT23Q9C075 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT23Q9C075 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT23Q9C075 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT23Q9C075 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT23Q9C075 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT23Q9C075 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT23Q9C075 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT23Q9C075 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT23Q9C075 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT23Q9C075 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT23Q9C075 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT23Q9C075 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT23Q9C075 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT23Q9C075 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT23Q9C075 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT23Q9C075 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT23Q9C075 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT23Q9C075 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT23Q9C075 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms