Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FOXQ1Q9C009 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FOXQ1Q9C009 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
FOXQ1Q9C009 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
FOXQ1Q9C009 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
FOXQ1Q9C009 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
FOXQ1Q9C009 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
FOXQ1Q9C009 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
FOXQ1Q9C009 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FOXQ1Q9C009 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
FOXQ1Q9C009 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
FOXQ1Q9C009 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
FOXQ1Q9C009 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
FOXQ1Q9C009 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FOXQ1Q9C009 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FOXQ1Q9C009 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
FOXQ1Q9C009 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FOXQ1Q9C009 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
FOXQ1Q9C009 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FOXQ1Q9C009 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
FOXQ1Q9C009 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
FOXQ1Q9C009 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
FOXQ1Q9C009 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
FOXQ1Q9C009 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
FOXQ1Q9C009 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
FOXQ1Q9C009 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
FOXQ1Q9C009 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
FOXQ1Q9C009 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
FOXQ1Q9C009 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
FOXQ1Q9C009 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
FOXQ1Q9C009 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
FOXQ1Q9C009 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
FOXQ1Q9C009 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
FOXQ1Q9C009 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
FOXQ1Q9C009 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
FOXQ1Q9C009 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
FOXQ1Q9C009 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
FOXQ1Q9C009 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
FOXQ1Q9C009 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
FOXQ1Q9C009 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
FOXQ1Q9C009 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
FOXQ1Q9C009 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
FOXQ1Q9C009 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
FOXQ1Q9C009 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
FOXQ1Q9C009 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
FOXQ1Q9C009 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
FOXQ1Q9C009 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
FOXQ1Q9C009 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
FOXQ1Q9C009 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
FOXQ1Q9C009 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
FOXQ1Q9C009 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
FOXQ1Q9C009 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
FOXQ1Q9C009 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
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FOXQ1Q9C009 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
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FOXQ1Q9C009 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
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FOXQ1Q9C009 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
FOXQ1Q9C009 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
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FOXQ1Q9C009 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
FOXQ1Q9C009 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
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FOXQ1Q9C009 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
FOXQ1Q9C009 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
FOXQ1Q9C009 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
FOXQ1Q9C009 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
FOXQ1Q9C009 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
FOXQ1Q9C009 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
FOXQ1Q9C009 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
FOXQ1Q9C009 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
FOXQ1Q9C009 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
FOXQ1Q9C009 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
FOXQ1Q9C009 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
FOXQ1Q9C009 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
FOXQ1Q9C009 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
FOXQ1Q9C009 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
FOXQ1Q9C009 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
FOXQ1Q9C009 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
FOXQ1Q9C009 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
FOXQ1Q9C009 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
FOXQ1Q9C009 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
FOXQ1Q9C009 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
FOXQ1Q9C009 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
FOXQ1Q9C009 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
FOXQ1Q9C009 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
FOXQ1Q9C009 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
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