Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY66

KDM5D, Lysine-specific demethylase 5D, humanhuman

Predictions only

Length 1,539 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5DQ9BY66 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
KDM5DQ9BY66 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
KDM5DQ9BY66 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
KDM5DQ9BY66 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
KDM5DQ9BY66 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
KDM5DQ9BY66 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
KDM5DQ9BY66 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
KDM5DQ9BY66 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
KDM5DQ9BY66 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
KDM5DQ9BY66 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
KDM5DQ9BY66 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
KDM5DQ9BY66 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
KDM5DQ9BY66 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
KDM5DQ9BY66 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
KDM5DQ9BY66 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
KDM5DQ9BY66 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
KDM5DQ9BY66 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
KDM5DQ9BY66 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
KDM5DQ9BY66 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
KDM5DQ9BY66 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
KDM5DQ9BY66 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
KDM5DQ9BY66 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
KDM5DQ9BY66 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
KDM5DQ9BY66 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
KDM5DQ9BY66 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
KDM5DQ9BY66 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
KDM5DQ9BY66 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
KDM5DQ9BY66 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
KDM5DQ9BY66 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
KDM5DQ9BY66 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
KDM5DQ9BY66 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
KDM5DQ9BY66 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
KDM5DQ9BY66 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
KDM5DQ9BY66 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
KDM5DQ9BY66 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
KDM5DQ9BY66 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
KDM5DQ9BY66 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
KDM5DQ9BY66 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
KDM5DQ9BY66 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
KDM5DQ9BY66 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
KDM5DQ9BY66 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
KDM5DQ9BY66 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
KDM5DQ9BY66 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
KDM5DQ9BY66 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
KDM5DQ9BY66 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
KDM5DQ9BY66 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
KDM5DQ9BY66 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC27.7■■■□□ 2.02
KDM5DQ9BY66 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
KDM5DQ9BY66 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
KDM5DQ9BY66 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
KDM5DQ9BY66 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
KDM5DQ9BY66 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
KDM5DQ9BY66 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
KDM5DQ9BY66 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
KDM5DQ9BY66 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
KDM5DQ9BY66 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
KDM5DQ9BY66 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
KDM5DQ9BY66 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
KDM5DQ9BY66 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
KDM5DQ9BY66 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
KDM5DQ9BY66 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
KDM5DQ9BY66 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
KDM5DQ9BY66 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
KDM5DQ9BY66 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
KDM5DQ9BY66 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
KDM5DQ9BY66 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
KDM5DQ9BY66 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
KDM5DQ9BY66 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
KDM5DQ9BY66 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
KDM5DQ9BY66 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
KDM5DQ9BY66 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
KDM5DQ9BY66 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
KDM5DQ9BY66 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
KDM5DQ9BY66 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
KDM5DQ9BY66 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
KDM5DQ9BY66 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
KDM5DQ9BY66 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
KDM5DQ9BY66 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
KDM5DQ9BY66 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
KDM5DQ9BY66 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
KDM5DQ9BY66 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
KDM5DQ9BY66 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
KDM5DQ9BY66 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
KDM5DQ9BY66 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
KDM5DQ9BY66 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
KDM5DQ9BY66 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
KDM5DQ9BY66 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC27.67■■■□□ 2.02
KDM5DQ9BY66 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
KDM5DQ9BY66 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
KDM5DQ9BY66 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
KDM5DQ9BY66 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
KDM5DQ9BY66 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
KDM5DQ9BY66 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
KDM5DQ9BY66 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
KDM5DQ9BY66 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
KDM5DQ9BY66 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
KDM5DQ9BY66 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
KDM5DQ9BY66 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
KDM5DQ9BY66 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
KDM5DQ9BY66 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms