Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRJ9

MESP1, Mesoderm posterior protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MESP1Q9BRJ9 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MESP1Q9BRJ9 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
MESP1Q9BRJ9 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MESP1Q9BRJ9 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
MESP1Q9BRJ9 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MESP1Q9BRJ9 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MESP1Q9BRJ9 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MESP1Q9BRJ9 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MESP1Q9BRJ9 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MESP1Q9BRJ9 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MESP1Q9BRJ9 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MESP1Q9BRJ9 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MESP1Q9BRJ9 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MESP1Q9BRJ9 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MESP1Q9BRJ9 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MESP1Q9BRJ9 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MESP1Q9BRJ9 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MESP1Q9BRJ9 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MESP1Q9BRJ9 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MESP1Q9BRJ9 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MESP1Q9BRJ9 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MESP1Q9BRJ9 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MESP1Q9BRJ9 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MESP1Q9BRJ9 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
MESP1Q9BRJ9 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MESP1Q9BRJ9 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
MESP1Q9BRJ9 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
MESP1Q9BRJ9 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
MESP1Q9BRJ9 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MESP1Q9BRJ9 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MESP1Q9BRJ9 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MESP1Q9BRJ9 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MESP1Q9BRJ9 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MESP1Q9BRJ9 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MESP1Q9BRJ9 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MESP1Q9BRJ9 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MESP1Q9BRJ9 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MESP1Q9BRJ9 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MESP1Q9BRJ9 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MESP1Q9BRJ9 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MESP1Q9BRJ9 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MESP1Q9BRJ9 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MESP1Q9BRJ9 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MESP1Q9BRJ9 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
MESP1Q9BRJ9 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
MESP1Q9BRJ9 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
MESP1Q9BRJ9 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
MESP1Q9BRJ9 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MESP1Q9BRJ9 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
MESP1Q9BRJ9 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
MESP1Q9BRJ9 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
MESP1Q9BRJ9 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
MESP1Q9BRJ9 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
MESP1Q9BRJ9 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MESP1Q9BRJ9 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MESP1Q9BRJ9 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MESP1Q9BRJ9 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MESP1Q9BRJ9 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
MESP1Q9BRJ9 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
MESP1Q9BRJ9 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
MESP1Q9BRJ9 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MESP1Q9BRJ9 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
MESP1Q9BRJ9 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
MESP1Q9BRJ9 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MESP1Q9BRJ9 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MESP1Q9BRJ9 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MESP1Q9BRJ9 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MESP1Q9BRJ9 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MESP1Q9BRJ9 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MESP1Q9BRJ9 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MESP1Q9BRJ9 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MESP1Q9BRJ9 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MESP1Q9BRJ9 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MESP1Q9BRJ9 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
MESP1Q9BRJ9 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MESP1Q9BRJ9 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MESP1Q9BRJ9 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MESP1Q9BRJ9 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MESP1Q9BRJ9 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MESP1Q9BRJ9 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MESP1Q9BRJ9 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
MESP1Q9BRJ9 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MESP1Q9BRJ9 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MESP1Q9BRJ9 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MESP1Q9BRJ9 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MESP1Q9BRJ9 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MESP1Q9BRJ9 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MESP1Q9BRJ9 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MESP1Q9BRJ9 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MESP1Q9BRJ9 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MESP1Q9BRJ9 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MESP1Q9BRJ9 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MESP1Q9BRJ9 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MESP1Q9BRJ9 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MESP1Q9BRJ9 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MESP1Q9BRJ9 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MESP1Q9BRJ9 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MESP1Q9BRJ9 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MESP1Q9BRJ9 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MESP1Q9BRJ9 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms