Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQD1

PMCHL2, Putative pro-MCH-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 86 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMCHL2Q9BQD1 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PMCHL2Q9BQD1 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PMCHL2Q9BQD1 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PMCHL2Q9BQD1 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PMCHL2Q9BQD1 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PMCHL2Q9BQD1 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PMCHL2Q9BQD1 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
PMCHL2Q9BQD1 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PMCHL2Q9BQD1 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PMCHL2Q9BQD1 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PMCHL2Q9BQD1 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PMCHL2Q9BQD1 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PMCHL2Q9BQD1 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PMCHL2Q9BQD1 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PMCHL2Q9BQD1 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PMCHL2Q9BQD1 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
PMCHL2Q9BQD1 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PMCHL2Q9BQD1 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PMCHL2Q9BQD1 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PMCHL2Q9BQD1 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PMCHL2Q9BQD1 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PMCHL2Q9BQD1 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PMCHL2Q9BQD1 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PMCHL2Q9BQD1 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PMCHL2Q9BQD1 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PMCHL2Q9BQD1 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PMCHL2Q9BQD1 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PMCHL2Q9BQD1 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PMCHL2Q9BQD1 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PMCHL2Q9BQD1 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PMCHL2Q9BQD1 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
PMCHL2Q9BQD1 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PMCHL2Q9BQD1 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PMCHL2Q9BQD1 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PMCHL2Q9BQD1 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
PMCHL2Q9BQD1 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
PMCHL2Q9BQD1 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
PMCHL2Q9BQD1 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
PMCHL2Q9BQD1 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PMCHL2Q9BQD1 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PMCHL2Q9BQD1 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PMCHL2Q9BQD1 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PMCHL2Q9BQD1 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PMCHL2Q9BQD1 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PMCHL2Q9BQD1 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PMCHL2Q9BQD1 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PMCHL2Q9BQD1 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PMCHL2Q9BQD1 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
PMCHL2Q9BQD1 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PMCHL2Q9BQD1 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PMCHL2Q9BQD1 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PMCHL2Q9BQD1 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PMCHL2Q9BQD1 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PMCHL2Q9BQD1 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PMCHL2Q9BQD1 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PMCHL2Q9BQD1 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PMCHL2Q9BQD1 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PMCHL2Q9BQD1 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PMCHL2Q9BQD1 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PMCHL2Q9BQD1 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PMCHL2Q9BQD1 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PMCHL2Q9BQD1 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PMCHL2Q9BQD1 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PMCHL2Q9BQD1 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PMCHL2Q9BQD1 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PMCHL2Q9BQD1 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PMCHL2Q9BQD1 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PMCHL2Q9BQD1 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PMCHL2Q9BQD1 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PMCHL2Q9BQD1 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PMCHL2Q9BQD1 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PMCHL2Q9BQD1 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PMCHL2Q9BQD1 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PMCHL2Q9BQD1 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PMCHL2Q9BQD1 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
PMCHL2Q9BQD1 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PMCHL2Q9BQD1 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PMCHL2Q9BQD1 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PMCHL2Q9BQD1 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PMCHL2Q9BQD1 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PMCHL2Q9BQD1 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PMCHL2Q9BQD1 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PMCHL2Q9BQD1 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PMCHL2Q9BQD1 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PMCHL2Q9BQD1 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PMCHL2Q9BQD1 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PMCHL2Q9BQD1 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PMCHL2Q9BQD1 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PMCHL2Q9BQD1 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PMCHL2Q9BQD1 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PMCHL2Q9BQD1 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PMCHL2Q9BQD1 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PMCHL2Q9BQD1 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PMCHL2Q9BQD1 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PMCHL2Q9BQD1 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
PMCHL2Q9BQD1 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PMCHL2Q9BQD1 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
PMCHL2Q9BQD1 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
PMCHL2Q9BQD1 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
PMCHL2Q9BQD1 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms