Protein–RNA interactions for Protein: Q99708

RBBP8, DNA endonuclease RBBP8, humanhuman

Predictions only

Length 897 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP8Q99708 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
RBBP8Q99708 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
RBBP8Q99708 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC18.8■□□□□ 0.6
RBBP8Q99708 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RBBP8Q99708 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RBBP8Q99708 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RBBP8Q99708 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
RBBP8Q99708 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
RBBP8Q99708 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
RBBP8Q99708 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RBBP8Q99708 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RBBP8Q99708 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RBBP8Q99708 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RBBP8Q99708 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RBBP8Q99708 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RBBP8Q99708 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RBBP8Q99708 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RBBP8Q99708 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RBBP8Q99708 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RBBP8Q99708 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RBBP8Q99708 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RBBP8Q99708 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RBBP8Q99708 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RBBP8Q99708 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RBBP8Q99708 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
RBBP8Q99708 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
RBBP8Q99708 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
RBBP8Q99708 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RBBP8Q99708 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RBBP8Q99708 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
RBBP8Q99708 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
RBBP8Q99708 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RBBP8Q99708 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RBBP8Q99708 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RBBP8Q99708 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RBBP8Q99708 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RBBP8Q99708 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RBBP8Q99708 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RBBP8Q99708 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RBBP8Q99708 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RBBP8Q99708 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RBBP8Q99708 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RBBP8Q99708 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RBBP8Q99708 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RBBP8Q99708 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RBBP8Q99708 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RBBP8Q99708 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RBBP8Q99708 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RBBP8Q99708 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
RBBP8Q99708 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RBBP8Q99708 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RBBP8Q99708 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RBBP8Q99708 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RBBP8Q99708 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RBBP8Q99708 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RBBP8Q99708 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RBBP8Q99708 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RBBP8Q99708 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RBBP8Q99708 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
RBBP8Q99708 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RBBP8Q99708 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RBBP8Q99708 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RBBP8Q99708 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RBBP8Q99708 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RBBP8Q99708 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RBBP8Q99708 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
RBBP8Q99708 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RBBP8Q99708 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RBBP8Q99708 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RBBP8Q99708 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RBBP8Q99708 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RBBP8Q99708 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RBBP8Q99708 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RBBP8Q99708 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RBBP8Q99708 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RBBP8Q99708 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RBBP8Q99708 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RBBP8Q99708 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RBBP8Q99708 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
RBBP8Q99708 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RBBP8Q99708 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RBBP8Q99708 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RBBP8Q99708 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RBBP8Q99708 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RBBP8Q99708 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RBBP8Q99708 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RBBP8Q99708 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RBBP8Q99708 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
RBBP8Q99708 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RBBP8Q99708 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RBBP8Q99708 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RBBP8Q99708 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RBBP8Q99708 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RBBP8Q99708 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RBBP8Q99708 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RBBP8Q99708 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RBBP8Q99708 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RBBP8Q99708 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
RBBP8Q99708 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
RBBP8Q99708 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms