Protein–RNA interactions for Protein: Q99567

NUP88, Nuclear pore complex protein Nup88, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP88Q99567 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NUP88Q99567 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NUP88Q99567 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NUP88Q99567 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NUP88Q99567 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NUP88Q99567 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NUP88Q99567 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NUP88Q99567 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
NUP88Q99567 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NUP88Q99567 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NUP88Q99567 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NUP88Q99567 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NUP88Q99567 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NUP88Q99567 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NUP88Q99567 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NUP88Q99567 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NUP88Q99567 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NUP88Q99567 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NUP88Q99567 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NUP88Q99567 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NUP88Q99567 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NUP88Q99567 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NUP88Q99567 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NUP88Q99567 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NUP88Q99567 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NUP88Q99567 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NUP88Q99567 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NUP88Q99567 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NUP88Q99567 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NUP88Q99567 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
NUP88Q99567 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
NUP88Q99567 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
NUP88Q99567 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NUP88Q99567 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NUP88Q99567 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NUP88Q99567 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NUP88Q99567 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NUP88Q99567 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
NUP88Q99567 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
NUP88Q99567 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NUP88Q99567 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
NUP88Q99567 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NUP88Q99567 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NUP88Q99567 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NUP88Q99567 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NUP88Q99567 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NUP88Q99567 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NUP88Q99567 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NUP88Q99567 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NUP88Q99567 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NUP88Q99567 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NUP88Q99567 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NUP88Q99567 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NUP88Q99567 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NUP88Q99567 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NUP88Q99567 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NUP88Q99567 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NUP88Q99567 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NUP88Q99567 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NUP88Q99567 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NUP88Q99567 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NUP88Q99567 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NUP88Q99567 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NUP88Q99567 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NUP88Q99567 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NUP88Q99567 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NUP88Q99567 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
NUP88Q99567 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NUP88Q99567 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NUP88Q99567 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NUP88Q99567 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NUP88Q99567 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NUP88Q99567 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NUP88Q99567 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NUP88Q99567 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NUP88Q99567 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NUP88Q99567 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NUP88Q99567 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NUP88Q99567 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NUP88Q99567 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NUP88Q99567 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NUP88Q99567 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NUP88Q99567 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NUP88Q99567 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
NUP88Q99567 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NUP88Q99567 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
NUP88Q99567 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NUP88Q99567 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NUP88Q99567 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NUP88Q99567 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NUP88Q99567 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NUP88Q99567 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NUP88Q99567 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NUP88Q99567 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NUP88Q99567 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NUP88Q99567 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NUP88Q99567 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NUP88Q99567 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NUP88Q99567 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NUP88Q99567 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms