Protein–RNA interactions for Protein: Q96ST3

SIN3A, Paired amphipathic helix protein Sin3a, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3AQ96ST3 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
SIN3AQ96ST3 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SIN3AQ96ST3 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SIN3AQ96ST3 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SIN3AQ96ST3 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SIN3AQ96ST3 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SIN3AQ96ST3 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
SIN3AQ96ST3 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SIN3AQ96ST3 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SIN3AQ96ST3 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SIN3AQ96ST3 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SIN3AQ96ST3 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SIN3AQ96ST3 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SIN3AQ96ST3 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
SIN3AQ96ST3 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
SIN3AQ96ST3 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SIN3AQ96ST3 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
SIN3AQ96ST3 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SIN3AQ96ST3 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SIN3AQ96ST3 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SIN3AQ96ST3 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SIN3AQ96ST3 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SIN3AQ96ST3 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SIN3AQ96ST3 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SIN3AQ96ST3 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
SIN3AQ96ST3 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SIN3AQ96ST3 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SIN3AQ96ST3 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SIN3AQ96ST3 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SIN3AQ96ST3 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SIN3AQ96ST3 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SIN3AQ96ST3 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SIN3AQ96ST3 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SIN3AQ96ST3 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SIN3AQ96ST3 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SIN3AQ96ST3 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SIN3AQ96ST3 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
SIN3AQ96ST3 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
SIN3AQ96ST3 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SIN3AQ96ST3 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SIN3AQ96ST3 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SIN3AQ96ST3 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SIN3AQ96ST3 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SIN3AQ96ST3 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SIN3AQ96ST3 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SIN3AQ96ST3 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SIN3AQ96ST3 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SIN3AQ96ST3 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SIN3AQ96ST3 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SIN3AQ96ST3 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SIN3AQ96ST3 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SIN3AQ96ST3 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SIN3AQ96ST3 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SIN3AQ96ST3 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SIN3AQ96ST3 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SIN3AQ96ST3 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SIN3AQ96ST3 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SIN3AQ96ST3 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SIN3AQ96ST3 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
SIN3AQ96ST3 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SIN3AQ96ST3 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SIN3AQ96ST3 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SIN3AQ96ST3 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SIN3AQ96ST3 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SIN3AQ96ST3 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SIN3AQ96ST3 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SIN3AQ96ST3 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SIN3AQ96ST3 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SIN3AQ96ST3 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SIN3AQ96ST3 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SIN3AQ96ST3 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SIN3AQ96ST3 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SIN3AQ96ST3 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SIN3AQ96ST3 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SIN3AQ96ST3 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SIN3AQ96ST3 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SIN3AQ96ST3 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SIN3AQ96ST3 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
SIN3AQ96ST3 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SIN3AQ96ST3 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SIN3AQ96ST3 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SIN3AQ96ST3 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
SIN3AQ96ST3 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
SIN3AQ96ST3 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SIN3AQ96ST3 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SIN3AQ96ST3 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SIN3AQ96ST3 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SIN3AQ96ST3 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SIN3AQ96ST3 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SIN3AQ96ST3 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SIN3AQ96ST3 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SIN3AQ96ST3 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SIN3AQ96ST3 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SIN3AQ96ST3 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SIN3AQ96ST3 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SIN3AQ96ST3 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SIN3AQ96ST3 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SIN3AQ96ST3 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SIN3AQ96ST3 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SIN3AQ96ST3 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms