Protein–RNA interactions for Protein: Q96SF2

CCT8L2, T-complex protein 1 subunit theta-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT8L2Q96SF2 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CCT8L2Q96SF2 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCT8L2Q96SF2 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCT8L2Q96SF2 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCT8L2Q96SF2 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCT8L2Q96SF2 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCT8L2Q96SF2 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCT8L2Q96SF2 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCT8L2Q96SF2 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCT8L2Q96SF2 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCT8L2Q96SF2 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCT8L2Q96SF2 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCT8L2Q96SF2 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCT8L2Q96SF2 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCT8L2Q96SF2 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCT8L2Q96SF2 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CCT8L2Q96SF2 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CCT8L2Q96SF2 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCT8L2Q96SF2 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CCT8L2Q96SF2 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCT8L2Q96SF2 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCT8L2Q96SF2 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCT8L2Q96SF2 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCT8L2Q96SF2 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCT8L2Q96SF2 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCT8L2Q96SF2 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCT8L2Q96SF2 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCT8L2Q96SF2 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCT8L2Q96SF2 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCT8L2Q96SF2 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCT8L2Q96SF2 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCT8L2Q96SF2 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCT8L2Q96SF2 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCT8L2Q96SF2 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCT8L2Q96SF2 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCT8L2Q96SF2 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCT8L2Q96SF2 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCT8L2Q96SF2 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCT8L2Q96SF2 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCT8L2Q96SF2 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCT8L2Q96SF2 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCT8L2Q96SF2 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCT8L2Q96SF2 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCT8L2Q96SF2 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCT8L2Q96SF2 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCT8L2Q96SF2 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCT8L2Q96SF2 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCT8L2Q96SF2 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCT8L2Q96SF2 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCT8L2Q96SF2 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCT8L2Q96SF2 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCT8L2Q96SF2 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCT8L2Q96SF2 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCT8L2Q96SF2 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCT8L2Q96SF2 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCT8L2Q96SF2 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCT8L2Q96SF2 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCT8L2Q96SF2 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCT8L2Q96SF2 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCT8L2Q96SF2 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCT8L2Q96SF2 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCT8L2Q96SF2 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCT8L2Q96SF2 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCT8L2Q96SF2 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCT8L2Q96SF2 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCT8L2Q96SF2 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCT8L2Q96SF2 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCT8L2Q96SF2 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCT8L2Q96SF2 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCT8L2Q96SF2 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCT8L2Q96SF2 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCT8L2Q96SF2 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCT8L2Q96SF2 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCT8L2Q96SF2 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCT8L2Q96SF2 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCT8L2Q96SF2 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCT8L2Q96SF2 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCT8L2Q96SF2 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCT8L2Q96SF2 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCT8L2Q96SF2 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCT8L2Q96SF2 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCT8L2Q96SF2 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCT8L2Q96SF2 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCT8L2Q96SF2 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCT8L2Q96SF2 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCT8L2Q96SF2 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCT8L2Q96SF2 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCT8L2Q96SF2 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCT8L2Q96SF2 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCT8L2Q96SF2 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCT8L2Q96SF2 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCT8L2Q96SF2 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CCT8L2Q96SF2 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CCT8L2Q96SF2 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCT8L2Q96SF2 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCT8L2Q96SF2 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCT8L2Q96SF2 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCT8L2Q96SF2 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCT8L2Q96SF2 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCT8L2Q96SF2 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms