Protein–RNA interactions for Protein: Q96S38

RPS6KC1, Ribosomal protein S6 kinase delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KC1Q96S38 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
RPS6KC1Q96S38 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
RPS6KC1Q96S38 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RPS6KC1Q96S38 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RPS6KC1Q96S38 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RPS6KC1Q96S38 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RPS6KC1Q96S38 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RPS6KC1Q96S38 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RPS6KC1Q96S38 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RPS6KC1Q96S38 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RPS6KC1Q96S38 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
RPS6KC1Q96S38 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RPS6KC1Q96S38 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RPS6KC1Q96S38 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RPS6KC1Q96S38 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RPS6KC1Q96S38 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RPS6KC1Q96S38 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RPS6KC1Q96S38 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RPS6KC1Q96S38 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
RPS6KC1Q96S38 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RPS6KC1Q96S38 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RPS6KC1Q96S38 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RPS6KC1Q96S38 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RPS6KC1Q96S38 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RPS6KC1Q96S38 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RPS6KC1Q96S38 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RPS6KC1Q96S38 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RPS6KC1Q96S38 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RPS6KC1Q96S38 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RPS6KC1Q96S38 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RPS6KC1Q96S38 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RPS6KC1Q96S38 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RPS6KC1Q96S38 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RPS6KC1Q96S38 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RPS6KC1Q96S38 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RPS6KC1Q96S38 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RPS6KC1Q96S38 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RPS6KC1Q96S38 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RPS6KC1Q96S38 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
RPS6KC1Q96S38 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RPS6KC1Q96S38 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RPS6KC1Q96S38 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RPS6KC1Q96S38 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RPS6KC1Q96S38 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RPS6KC1Q96S38 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RPS6KC1Q96S38 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RPS6KC1Q96S38 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RPS6KC1Q96S38 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RPS6KC1Q96S38 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RPS6KC1Q96S38 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RPS6KC1Q96S38 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RPS6KC1Q96S38 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RPS6KC1Q96S38 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RPS6KC1Q96S38 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RPS6KC1Q96S38 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RPS6KC1Q96S38 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RPS6KC1Q96S38 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RPS6KC1Q96S38 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RPS6KC1Q96S38 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RPS6KC1Q96S38 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RPS6KC1Q96S38 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
RPS6KC1Q96S38 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
RPS6KC1Q96S38 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RPS6KC1Q96S38 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RPS6KC1Q96S38 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RPS6KC1Q96S38 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RPS6KC1Q96S38 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RPS6KC1Q96S38 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RPS6KC1Q96S38 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RPS6KC1Q96S38 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RPS6KC1Q96S38 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
RPS6KC1Q96S38 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RPS6KC1Q96S38 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RPS6KC1Q96S38 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RPS6KC1Q96S38 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RPS6KC1Q96S38 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RPS6KC1Q96S38 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RPS6KC1Q96S38 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RPS6KC1Q96S38 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RPS6KC1Q96S38 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RPS6KC1Q96S38 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RPS6KC1Q96S38 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RPS6KC1Q96S38 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
RPS6KC1Q96S38 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RPS6KC1Q96S38 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RPS6KC1Q96S38 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RPS6KC1Q96S38 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RPS6KC1Q96S38 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RPS6KC1Q96S38 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RPS6KC1Q96S38 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RPS6KC1Q96S38 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
RPS6KC1Q96S38 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RPS6KC1Q96S38 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RPS6KC1Q96S38 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
RPS6KC1Q96S38 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
RPS6KC1Q96S38 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RPS6KC1Q96S38 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RPS6KC1Q96S38 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RPS6KC1Q96S38 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RPS6KC1Q96S38 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms