Protein–RNA interactions for Protein: Q96RP9

GFM1, Elongation factor G, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 751 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFM1Q96RP9 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GFM1Q96RP9 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GFM1Q96RP9 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GFM1Q96RP9 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GFM1Q96RP9 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GFM1Q96RP9 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GFM1Q96RP9 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GFM1Q96RP9 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GFM1Q96RP9 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GFM1Q96RP9 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GFM1Q96RP9 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GFM1Q96RP9 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GFM1Q96RP9 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GFM1Q96RP9 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GFM1Q96RP9 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GFM1Q96RP9 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GFM1Q96RP9 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GFM1Q96RP9 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GFM1Q96RP9 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GFM1Q96RP9 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GFM1Q96RP9 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GFM1Q96RP9 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GFM1Q96RP9 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GFM1Q96RP9 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GFM1Q96RP9 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
GFM1Q96RP9 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GFM1Q96RP9 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GFM1Q96RP9 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GFM1Q96RP9 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GFM1Q96RP9 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GFM1Q96RP9 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GFM1Q96RP9 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GFM1Q96RP9 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GFM1Q96RP9 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GFM1Q96RP9 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GFM1Q96RP9 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GFM1Q96RP9 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GFM1Q96RP9 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GFM1Q96RP9 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GFM1Q96RP9 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GFM1Q96RP9 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GFM1Q96RP9 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GFM1Q96RP9 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GFM1Q96RP9 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GFM1Q96RP9 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GFM1Q96RP9 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GFM1Q96RP9 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GFM1Q96RP9 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
GFM1Q96RP9 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GFM1Q96RP9 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GFM1Q96RP9 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GFM1Q96RP9 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GFM1Q96RP9 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GFM1Q96RP9 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GFM1Q96RP9 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GFM1Q96RP9 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GFM1Q96RP9 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GFM1Q96RP9 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GFM1Q96RP9 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
GFM1Q96RP9 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GFM1Q96RP9 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GFM1Q96RP9 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GFM1Q96RP9 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GFM1Q96RP9 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GFM1Q96RP9 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GFM1Q96RP9 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GFM1Q96RP9 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GFM1Q96RP9 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GFM1Q96RP9 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GFM1Q96RP9 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GFM1Q96RP9 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GFM1Q96RP9 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
GFM1Q96RP9 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GFM1Q96RP9 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GFM1Q96RP9 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GFM1Q96RP9 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GFM1Q96RP9 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GFM1Q96RP9 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GFM1Q96RP9 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
GFM1Q96RP9 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GFM1Q96RP9 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GFM1Q96RP9 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GFM1Q96RP9 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GFM1Q96RP9 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GFM1Q96RP9 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GFM1Q96RP9 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GFM1Q96RP9 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GFM1Q96RP9 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
GFM1Q96RP9 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GFM1Q96RP9 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GFM1Q96RP9 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GFM1Q96RP9 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GFM1Q96RP9 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GFM1Q96RP9 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GFM1Q96RP9 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GFM1Q96RP9 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GFM1Q96RP9 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GFM1Q96RP9 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GFM1Q96RP9 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GFM1Q96RP9 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms