Protein–RNA interactions for Protein: Q96LY2

CCDC74B, Coiled-coil domain-containing protein 74B, humanhuman

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC74BQ96LY2 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC74BQ96LY2 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC74BQ96LY2 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC74BQ96LY2 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC74BQ96LY2 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC74BQ96LY2 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC74BQ96LY2 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC74BQ96LY2 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC74BQ96LY2 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC74BQ96LY2 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC74BQ96LY2 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC74BQ96LY2 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC74BQ96LY2 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC74BQ96LY2 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC74BQ96LY2 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC74BQ96LY2 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC74BQ96LY2 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC74BQ96LY2 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC74BQ96LY2 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC74BQ96LY2 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC74BQ96LY2 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC74BQ96LY2 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC74BQ96LY2 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC74BQ96LY2 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC74BQ96LY2 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC74BQ96LY2 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC74BQ96LY2 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC74BQ96LY2 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC74BQ96LY2 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC74BQ96LY2 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC74BQ96LY2 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC74BQ96LY2 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC74BQ96LY2 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC74BQ96LY2 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC74BQ96LY2 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC74BQ96LY2 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC74BQ96LY2 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC74BQ96LY2 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC74BQ96LY2 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC74BQ96LY2 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC74BQ96LY2 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC74BQ96LY2 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC74BQ96LY2 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC74BQ96LY2 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC74BQ96LY2 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC74BQ96LY2 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC74BQ96LY2 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC74BQ96LY2 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC74BQ96LY2 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC74BQ96LY2 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC74BQ96LY2 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC74BQ96LY2 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC74BQ96LY2 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC74BQ96LY2 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC74BQ96LY2 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC74BQ96LY2 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC74BQ96LY2 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC74BQ96LY2 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC74BQ96LY2 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC74BQ96LY2 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC74BQ96LY2 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC74BQ96LY2 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC74BQ96LY2 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC74BQ96LY2 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC74BQ96LY2 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC74BQ96LY2 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC74BQ96LY2 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC74BQ96LY2 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC74BQ96LY2 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC74BQ96LY2 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC74BQ96LY2 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC74BQ96LY2 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC74BQ96LY2 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC74BQ96LY2 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC74BQ96LY2 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC74BQ96LY2 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC74BQ96LY2 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC74BQ96LY2 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC74BQ96LY2 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC74BQ96LY2 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC74BQ96LY2 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC74BQ96LY2 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC74BQ96LY2 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC74BQ96LY2 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC74BQ96LY2 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC74BQ96LY2 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC74BQ96LY2 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC74BQ96LY2 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC74BQ96LY2 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC74BQ96LY2 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC74BQ96LY2 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC74BQ96LY2 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC74BQ96LY2 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC74BQ96LY2 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC74BQ96LY2 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC74BQ96LY2 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC74BQ96LY2 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC74BQ96LY2 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC74BQ96LY2 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC74BQ96LY2 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms