Protein–RNA interactions for Protein: Q96GW7

BCAN, Brevican core protein, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCANQ96GW7 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
BCANQ96GW7 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
BCANQ96GW7 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
BCANQ96GW7 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
BCANQ96GW7 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
BCANQ96GW7 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
BCANQ96GW7 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
BCANQ96GW7 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC27.31■■□□□ 1.96
BCANQ96GW7 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
BCANQ96GW7 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
BCANQ96GW7 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
BCANQ96GW7 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
BCANQ96GW7 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
BCANQ96GW7 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
BCANQ96GW7 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
BCANQ96GW7 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
BCANQ96GW7 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
BCANQ96GW7 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
BCANQ96GW7 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
BCANQ96GW7 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
BCANQ96GW7 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
BCANQ96GW7 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
BCANQ96GW7 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
BCANQ96GW7 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
BCANQ96GW7 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
BCANQ96GW7 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
BCANQ96GW7 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
BCANQ96GW7 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
BCANQ96GW7 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
BCANQ96GW7 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC27.3■■□□□ 1.96
BCANQ96GW7 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
BCANQ96GW7 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
BCANQ96GW7 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
BCANQ96GW7 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
BCANQ96GW7 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
BCANQ96GW7 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
BCANQ96GW7 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
BCANQ96GW7 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
BCANQ96GW7 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
BCANQ96GW7 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
BCANQ96GW7 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
BCANQ96GW7 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
BCANQ96GW7 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
BCANQ96GW7 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
BCANQ96GW7 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
BCANQ96GW7 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
BCANQ96GW7 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
BCANQ96GW7 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
BCANQ96GW7 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
BCANQ96GW7 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
BCANQ96GW7 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
BCANQ96GW7 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
BCANQ96GW7 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
BCANQ96GW7 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
BCANQ96GW7 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
BCANQ96GW7 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
BCANQ96GW7 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
BCANQ96GW7 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
BCANQ96GW7 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
BCANQ96GW7 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
BCANQ96GW7 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
BCANQ96GW7 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
BCANQ96GW7 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
BCANQ96GW7 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
BCANQ96GW7 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC27.28■■□□□ 1.96
BCANQ96GW7 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
BCANQ96GW7 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
BCANQ96GW7 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
BCANQ96GW7 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
BCANQ96GW7 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
BCANQ96GW7 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
BCANQ96GW7 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
BCANQ96GW7 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
BCANQ96GW7 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
BCANQ96GW7 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
BCANQ96GW7 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
BCANQ96GW7 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
BCANQ96GW7 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
BCANQ96GW7 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
BCANQ96GW7 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
BCANQ96GW7 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
BCANQ96GW7 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
BCANQ96GW7 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
BCANQ96GW7 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
BCANQ96GW7 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
BCANQ96GW7 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
BCANQ96GW7 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC27.27■■□□□ 1.96
BCANQ96GW7 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
BCANQ96GW7 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
BCANQ96GW7 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
BCANQ96GW7 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
BCANQ96GW7 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
BCANQ96GW7 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
BCANQ96GW7 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
BCANQ96GW7 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
BCANQ96GW7 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
BCANQ96GW7 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.96
BCANQ96GW7 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.96
BCANQ96GW7 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
BCANQ96GW7 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms