Protein–RNA interactions for Protein: Q96DT6

ATG4C, Cysteine protease ATG4C, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4CQ96DT6 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATG4CQ96DT6 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATG4CQ96DT6 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATG4CQ96DT6 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
ATG4CQ96DT6 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATG4CQ96DT6 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
ATG4CQ96DT6 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
ATG4CQ96DT6 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
ATG4CQ96DT6 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
ATG4CQ96DT6 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATG4CQ96DT6 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATG4CQ96DT6 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATG4CQ96DT6 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATG4CQ96DT6 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATG4CQ96DT6 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATG4CQ96DT6 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATG4CQ96DT6 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATG4CQ96DT6 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATG4CQ96DT6 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATG4CQ96DT6 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATG4CQ96DT6 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATG4CQ96DT6 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATG4CQ96DT6 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATG4CQ96DT6 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATG4CQ96DT6 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATG4CQ96DT6 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATG4CQ96DT6 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATG4CQ96DT6 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATG4CQ96DT6 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATG4CQ96DT6 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATG4CQ96DT6 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATG4CQ96DT6 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATG4CQ96DT6 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
ATG4CQ96DT6 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATG4CQ96DT6 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATG4CQ96DT6 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATG4CQ96DT6 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATG4CQ96DT6 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATG4CQ96DT6 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATG4CQ96DT6 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATG4CQ96DT6 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATG4CQ96DT6 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATG4CQ96DT6 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATG4CQ96DT6 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATG4CQ96DT6 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATG4CQ96DT6 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATG4CQ96DT6 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATG4CQ96DT6 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATG4CQ96DT6 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATG4CQ96DT6 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATG4CQ96DT6 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATG4CQ96DT6 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATG4CQ96DT6 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATG4CQ96DT6 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATG4CQ96DT6 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATG4CQ96DT6 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATG4CQ96DT6 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATG4CQ96DT6 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATG4CQ96DT6 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATG4CQ96DT6 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATG4CQ96DT6 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATG4CQ96DT6 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATG4CQ96DT6 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATG4CQ96DT6 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATG4CQ96DT6 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATG4CQ96DT6 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATG4CQ96DT6 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATG4CQ96DT6 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATG4CQ96DT6 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATG4CQ96DT6 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATG4CQ96DT6 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATG4CQ96DT6 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATG4CQ96DT6 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATG4CQ96DT6 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
ATG4CQ96DT6 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATG4CQ96DT6 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATG4CQ96DT6 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATG4CQ96DT6 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATG4CQ96DT6 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATG4CQ96DT6 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATG4CQ96DT6 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATG4CQ96DT6 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATG4CQ96DT6 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATG4CQ96DT6 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ATG4CQ96DT6 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATG4CQ96DT6 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATG4CQ96DT6 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATG4CQ96DT6 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATG4CQ96DT6 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATG4CQ96DT6 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATG4CQ96DT6 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATG4CQ96DT6 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATG4CQ96DT6 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATG4CQ96DT6 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATG4CQ96DT6 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATG4CQ96DT6 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATG4CQ96DT6 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATG4CQ96DT6 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATG4CQ96DT6 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ATG4CQ96DT6 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms