Protein–RNA interactions for Protein: Q96C34

RUNDC1, RUN domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNDC1Q96C34 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RUNDC1Q96C34 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RUNDC1Q96C34 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RUNDC1Q96C34 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RUNDC1Q96C34 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RUNDC1Q96C34 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RUNDC1Q96C34 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RUNDC1Q96C34 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RUNDC1Q96C34 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RUNDC1Q96C34 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RUNDC1Q96C34 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RUNDC1Q96C34 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RUNDC1Q96C34 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RUNDC1Q96C34 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
RUNDC1Q96C34 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RUNDC1Q96C34 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RUNDC1Q96C34 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RUNDC1Q96C34 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RUNDC1Q96C34 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RUNDC1Q96C34 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RUNDC1Q96C34 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RUNDC1Q96C34 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RUNDC1Q96C34 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RUNDC1Q96C34 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RUNDC1Q96C34 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RUNDC1Q96C34 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RUNDC1Q96C34 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RUNDC1Q96C34 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RUNDC1Q96C34 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RUNDC1Q96C34 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
RUNDC1Q96C34 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
RUNDC1Q96C34 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RUNDC1Q96C34 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RUNDC1Q96C34 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RUNDC1Q96C34 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RUNDC1Q96C34 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RUNDC1Q96C34 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RUNDC1Q96C34 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RUNDC1Q96C34 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RUNDC1Q96C34 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RUNDC1Q96C34 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RUNDC1Q96C34 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RUNDC1Q96C34 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RUNDC1Q96C34 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RUNDC1Q96C34 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RUNDC1Q96C34 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RUNDC1Q96C34 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
RUNDC1Q96C34 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RUNDC1Q96C34 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RUNDC1Q96C34 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RUNDC1Q96C34 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RUNDC1Q96C34 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RUNDC1Q96C34 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
RUNDC1Q96C34 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RUNDC1Q96C34 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RUNDC1Q96C34 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RUNDC1Q96C34 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
RUNDC1Q96C34 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RUNDC1Q96C34 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RUNDC1Q96C34 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RUNDC1Q96C34 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
RUNDC1Q96C34 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RUNDC1Q96C34 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RUNDC1Q96C34 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RUNDC1Q96C34 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RUNDC1Q96C34 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RUNDC1Q96C34 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RUNDC1Q96C34 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RUNDC1Q96C34 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RUNDC1Q96C34 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RUNDC1Q96C34 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RUNDC1Q96C34 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RUNDC1Q96C34 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RUNDC1Q96C34 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RUNDC1Q96C34 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RUNDC1Q96C34 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RUNDC1Q96C34 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RUNDC1Q96C34 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RUNDC1Q96C34 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RUNDC1Q96C34 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RUNDC1Q96C34 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RUNDC1Q96C34 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RUNDC1Q96C34 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
RUNDC1Q96C34 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RUNDC1Q96C34 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RUNDC1Q96C34 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RUNDC1Q96C34 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RUNDC1Q96C34 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RUNDC1Q96C34 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RUNDC1Q96C34 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RUNDC1Q96C34 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RUNDC1Q96C34 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RUNDC1Q96C34 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RUNDC1Q96C34 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RUNDC1Q96C34 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RUNDC1Q96C34 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RUNDC1Q96C34 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RUNDC1Q96C34 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RUNDC1Q96C34 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RUNDC1Q96C34 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms