Protein–RNA interactions for Protein: Q92838

EDA, Ectodysplasin-A, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDAQ92838 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
EDAQ92838 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
EDAQ92838 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
EDAQ92838 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
EDAQ92838 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
EDAQ92838 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
EDAQ92838 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
EDAQ92838 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
EDAQ92838 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
EDAQ92838 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
EDAQ92838 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
EDAQ92838 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
EDAQ92838 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
EDAQ92838 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
EDAQ92838 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
EDAQ92838 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
EDAQ92838 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
EDAQ92838 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
EDAQ92838 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
EDAQ92838 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
EDAQ92838 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
EDAQ92838 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
EDAQ92838 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
EDAQ92838 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
EDAQ92838 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
EDAQ92838 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
EDAQ92838 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
EDAQ92838 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
EDAQ92838 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
EDAQ92838 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
EDAQ92838 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
EDAQ92838 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
EDAQ92838 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
EDAQ92838 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
EDAQ92838 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
EDAQ92838 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
EDAQ92838 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
EDAQ92838 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
EDAQ92838 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
EDAQ92838 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
EDAQ92838 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
EDAQ92838 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
EDAQ92838 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
EDAQ92838 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
EDAQ92838 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
EDAQ92838 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
EDAQ92838 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
EDAQ92838 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
EDAQ92838 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
EDAQ92838 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
EDAQ92838 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
EDAQ92838 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
EDAQ92838 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
EDAQ92838 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
EDAQ92838 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
EDAQ92838 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
EDAQ92838 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
EDAQ92838 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
EDAQ92838 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
EDAQ92838 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
EDAQ92838 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
EDAQ92838 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
EDAQ92838 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
EDAQ92838 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
EDAQ92838 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
EDAQ92838 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
EDAQ92838 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
EDAQ92838 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
EDAQ92838 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
EDAQ92838 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
EDAQ92838 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
EDAQ92838 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
EDAQ92838 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
EDAQ92838 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
EDAQ92838 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
EDAQ92838 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
EDAQ92838 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
EDAQ92838 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
EDAQ92838 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
EDAQ92838 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
EDAQ92838 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
EDAQ92838 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
EDAQ92838 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
EDAQ92838 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
EDAQ92838 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
EDAQ92838 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
EDAQ92838 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
EDAQ92838 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
EDAQ92838 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
EDAQ92838 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
EDAQ92838 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
EDAQ92838 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
EDAQ92838 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
EDAQ92838 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
EDAQ92838 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
EDAQ92838 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
EDAQ92838 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
EDAQ92838 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
EDAQ92838 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
EDAQ92838 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms