Protein–RNA interactions for Protein: Q8WX93

PALLD, Palladin, humanhuman

Predictions only

Length 1,383 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALLDQ8WX93 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PALLDQ8WX93 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PALLDQ8WX93 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PALLDQ8WX93 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PALLDQ8WX93 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PALLDQ8WX93 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PALLDQ8WX93 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PALLDQ8WX93 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PALLDQ8WX93 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PALLDQ8WX93 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PALLDQ8WX93 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PALLDQ8WX93 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PALLDQ8WX93 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PALLDQ8WX93 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PALLDQ8WX93 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PALLDQ8WX93 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PALLDQ8WX93 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PALLDQ8WX93 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PALLDQ8WX93 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PALLDQ8WX93 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PALLDQ8WX93 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PALLDQ8WX93 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PALLDQ8WX93 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PALLDQ8WX93 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PALLDQ8WX93 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PALLDQ8WX93 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PALLDQ8WX93 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PALLDQ8WX93 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PALLDQ8WX93 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PALLDQ8WX93 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PALLDQ8WX93 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PALLDQ8WX93 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PALLDQ8WX93 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PALLDQ8WX93 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PALLDQ8WX93 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PALLDQ8WX93 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PALLDQ8WX93 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PALLDQ8WX93 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PALLDQ8WX93 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PALLDQ8WX93 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PALLDQ8WX93 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PALLDQ8WX93 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PALLDQ8WX93 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PALLDQ8WX93 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PALLDQ8WX93 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PALLDQ8WX93 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PALLDQ8WX93 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PALLDQ8WX93 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PALLDQ8WX93 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PALLDQ8WX93 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PALLDQ8WX93 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PALLDQ8WX93 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PALLDQ8WX93 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PALLDQ8WX93 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PALLDQ8WX93 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PALLDQ8WX93 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PALLDQ8WX93 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PALLDQ8WX93 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PALLDQ8WX93 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PALLDQ8WX93 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PALLDQ8WX93 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PALLDQ8WX93 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PALLDQ8WX93 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PALLDQ8WX93 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PALLDQ8WX93 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PALLDQ8WX93 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PALLDQ8WX93 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PALLDQ8WX93 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PALLDQ8WX93 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PALLDQ8WX93 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PALLDQ8WX93 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PALLDQ8WX93 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PALLDQ8WX93 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PALLDQ8WX93 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PALLDQ8WX93 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PALLDQ8WX93 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PALLDQ8WX93 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PALLDQ8WX93 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PALLDQ8WX93 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PALLDQ8WX93 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PALLDQ8WX93 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PALLDQ8WX93 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PALLDQ8WX93 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PALLDQ8WX93 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PALLDQ8WX93 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PALLDQ8WX93 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PALLDQ8WX93 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PALLDQ8WX93 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PALLDQ8WX93 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PALLDQ8WX93 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PALLDQ8WX93 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PALLDQ8WX93 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PALLDQ8WX93 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PALLDQ8WX93 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PALLDQ8WX93 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PALLDQ8WX93 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PALLDQ8WX93 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PALLDQ8WX93 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PALLDQ8WX93 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PALLDQ8WX93 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms