Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVE6

TMEM171, Transmembrane protein 171, humanhuman

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM171Q8WVE6 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM171Q8WVE6 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM171Q8WVE6 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM171Q8WVE6 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM171Q8WVE6 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM171Q8WVE6 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM171Q8WVE6 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM171Q8WVE6 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM171Q8WVE6 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM171Q8WVE6 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM171Q8WVE6 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM171Q8WVE6 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM171Q8WVE6 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM171Q8WVE6 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM171Q8WVE6 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM171Q8WVE6 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM171Q8WVE6 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM171Q8WVE6 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM171Q8WVE6 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM171Q8WVE6 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM171Q8WVE6 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM171Q8WVE6 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM171Q8WVE6 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM171Q8WVE6 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM171Q8WVE6 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM171Q8WVE6 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM171Q8WVE6 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM171Q8WVE6 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM171Q8WVE6 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM171Q8WVE6 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM171Q8WVE6 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM171Q8WVE6 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM171Q8WVE6 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM171Q8WVE6 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM171Q8WVE6 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM171Q8WVE6 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM171Q8WVE6 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM171Q8WVE6 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM171Q8WVE6 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM171Q8WVE6 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM171Q8WVE6 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM171Q8WVE6 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM171Q8WVE6 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM171Q8WVE6 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM171Q8WVE6 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM171Q8WVE6 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM171Q8WVE6 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM171Q8WVE6 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM171Q8WVE6 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM171Q8WVE6 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM171Q8WVE6 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM171Q8WVE6 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM171Q8WVE6 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM171Q8WVE6 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM171Q8WVE6 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM171Q8WVE6 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM171Q8WVE6 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM171Q8WVE6 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM171Q8WVE6 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM171Q8WVE6 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM171Q8WVE6 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM171Q8WVE6 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM171Q8WVE6 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM171Q8WVE6 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM171Q8WVE6 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM171Q8WVE6 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM171Q8WVE6 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM171Q8WVE6 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM171Q8WVE6 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM171Q8WVE6 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM171Q8WVE6 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM171Q8WVE6 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM171Q8WVE6 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM171Q8WVE6 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM171Q8WVE6 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM171Q8WVE6 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM171Q8WVE6 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM171Q8WVE6 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM171Q8WVE6 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM171Q8WVE6 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM171Q8WVE6 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM171Q8WVE6 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM171Q8WVE6 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM171Q8WVE6 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM171Q8WVE6 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM171Q8WVE6 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM171Q8WVE6 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM171Q8WVE6 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM171Q8WVE6 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM171Q8WVE6 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM171Q8WVE6 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM171Q8WVE6 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM171Q8WVE6 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM171Q8WVE6 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM171Q8WVE6 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM171Q8WVE6 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM171Q8WVE6 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM171Q8WVE6 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM171Q8WVE6 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM171Q8WVE6 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms