Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDD5

MCOLN3, Mucolipin-3, humanhuman

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCOLN3Q8TDD5 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
MCOLN3Q8TDD5 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
MCOLN3Q8TDD5 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MCOLN3Q8TDD5 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
MCOLN3Q8TDD5 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MCOLN3Q8TDD5 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MCOLN3Q8TDD5 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MCOLN3Q8TDD5 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MCOLN3Q8TDD5 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MCOLN3Q8TDD5 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MCOLN3Q8TDD5 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
MCOLN3Q8TDD5 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MCOLN3Q8TDD5 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MCOLN3Q8TDD5 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MCOLN3Q8TDD5 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MCOLN3Q8TDD5 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
MCOLN3Q8TDD5 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
MCOLN3Q8TDD5 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
MCOLN3Q8TDD5 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
MCOLN3Q8TDD5 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MCOLN3Q8TDD5 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MCOLN3Q8TDD5 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MCOLN3Q8TDD5 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MCOLN3Q8TDD5 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MCOLN3Q8TDD5 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MCOLN3Q8TDD5 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
MCOLN3Q8TDD5 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
MCOLN3Q8TDD5 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MCOLN3Q8TDD5 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MCOLN3Q8TDD5 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MCOLN3Q8TDD5 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MCOLN3Q8TDD5 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MCOLN3Q8TDD5 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MCOLN3Q8TDD5 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MCOLN3Q8TDD5 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MCOLN3Q8TDD5 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MCOLN3Q8TDD5 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MCOLN3Q8TDD5 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MCOLN3Q8TDD5 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MCOLN3Q8TDD5 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
MCOLN3Q8TDD5 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MCOLN3Q8TDD5 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MCOLN3Q8TDD5 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MCOLN3Q8TDD5 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MCOLN3Q8TDD5 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MCOLN3Q8TDD5 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MCOLN3Q8TDD5 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MCOLN3Q8TDD5 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MCOLN3Q8TDD5 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MCOLN3Q8TDD5 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MCOLN3Q8TDD5 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MCOLN3Q8TDD5 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MCOLN3Q8TDD5 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MCOLN3Q8TDD5 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MCOLN3Q8TDD5 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MCOLN3Q8TDD5 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MCOLN3Q8TDD5 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MCOLN3Q8TDD5 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MCOLN3Q8TDD5 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MCOLN3Q8TDD5 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MCOLN3Q8TDD5 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MCOLN3Q8TDD5 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MCOLN3Q8TDD5 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MCOLN3Q8TDD5 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MCOLN3Q8TDD5 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MCOLN3Q8TDD5 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MCOLN3Q8TDD5 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MCOLN3Q8TDD5 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MCOLN3Q8TDD5 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MCOLN3Q8TDD5 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MCOLN3Q8TDD5 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MCOLN3Q8TDD5 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MCOLN3Q8TDD5 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MCOLN3Q8TDD5 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MCOLN3Q8TDD5 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MCOLN3Q8TDD5 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MCOLN3Q8TDD5 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MCOLN3Q8TDD5 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MCOLN3Q8TDD5 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MCOLN3Q8TDD5 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MCOLN3Q8TDD5 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MCOLN3Q8TDD5 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MCOLN3Q8TDD5 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MCOLN3Q8TDD5 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MCOLN3Q8TDD5 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MCOLN3Q8TDD5 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MCOLN3Q8TDD5 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MCOLN3Q8TDD5 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MCOLN3Q8TDD5 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MCOLN3Q8TDD5 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MCOLN3Q8TDD5 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MCOLN3Q8TDD5 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MCOLN3Q8TDD5 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MCOLN3Q8TDD5 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MCOLN3Q8TDD5 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
MCOLN3Q8TDD5 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
MCOLN3Q8TDD5 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MCOLN3Q8TDD5 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
MCOLN3Q8TDD5 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MCOLN3Q8TDD5 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms