Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFR7

CCDC148, Coiled-coil domain-containing protein 148, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC148Q8NFR7 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC148Q8NFR7 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC148Q8NFR7 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC148Q8NFR7 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC148Q8NFR7 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC148Q8NFR7 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC148Q8NFR7 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC148Q8NFR7 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC148Q8NFR7 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC148Q8NFR7 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC148Q8NFR7 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC148Q8NFR7 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC148Q8NFR7 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC148Q8NFR7 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC148Q8NFR7 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC148Q8NFR7 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC148Q8NFR7 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC148Q8NFR7 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC148Q8NFR7 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC148Q8NFR7 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC148Q8NFR7 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC148Q8NFR7 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC148Q8NFR7 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC148Q8NFR7 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC148Q8NFR7 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC148Q8NFR7 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC148Q8NFR7 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC148Q8NFR7 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC148Q8NFR7 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC148Q8NFR7 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC148Q8NFR7 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC148Q8NFR7 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC148Q8NFR7 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC148Q8NFR7 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC148Q8NFR7 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC148Q8NFR7 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC148Q8NFR7 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC148Q8NFR7 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC148Q8NFR7 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC148Q8NFR7 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC148Q8NFR7 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC148Q8NFR7 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC148Q8NFR7 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC148Q8NFR7 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC148Q8NFR7 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC148Q8NFR7 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC148Q8NFR7 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC148Q8NFR7 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC148Q8NFR7 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC148Q8NFR7 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC148Q8NFR7 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC148Q8NFR7 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC148Q8NFR7 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC148Q8NFR7 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC148Q8NFR7 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC148Q8NFR7 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC148Q8NFR7 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC148Q8NFR7 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC148Q8NFR7 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC148Q8NFR7 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC148Q8NFR7 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC148Q8NFR7 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC148Q8NFR7 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC148Q8NFR7 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC148Q8NFR7 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC148Q8NFR7 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC148Q8NFR7 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC148Q8NFR7 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC148Q8NFR7 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC148Q8NFR7 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC148Q8NFR7 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC148Q8NFR7 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC148Q8NFR7 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC148Q8NFR7 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC148Q8NFR7 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC148Q8NFR7 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC148Q8NFR7 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC148Q8NFR7 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC148Q8NFR7 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC148Q8NFR7 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC148Q8NFR7 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC148Q8NFR7 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC148Q8NFR7 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC148Q8NFR7 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC148Q8NFR7 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC148Q8NFR7 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC148Q8NFR7 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC148Q8NFR7 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC148Q8NFR7 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC148Q8NFR7 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC148Q8NFR7 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC148Q8NFR7 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC148Q8NFR7 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC148Q8NFR7 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC148Q8NFR7 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC148Q8NFR7 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC148Q8NFR7 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC148Q8NFR7 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC148Q8NFR7 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC148Q8NFR7 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
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